Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI8

CRLF3, Cytokine receptor-like factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRLF3Q8IUI8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CRLF3Q8IUI8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRLF3Q8IUI8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRLF3Q8IUI8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRLF3Q8IUI8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRLF3Q8IUI8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRLF3Q8IUI8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRLF3Q8IUI8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRLF3Q8IUI8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRLF3Q8IUI8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRLF3Q8IUI8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRLF3Q8IUI8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRLF3Q8IUI8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRLF3Q8IUI8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRLF3Q8IUI8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRLF3Q8IUI8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRLF3Q8IUI8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRLF3Q8IUI8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRLF3Q8IUI8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRLF3Q8IUI8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRLF3Q8IUI8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRLF3Q8IUI8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CRLF3Q8IUI8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRLF3Q8IUI8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRLF3Q8IUI8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRLF3Q8IUI8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRLF3Q8IUI8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRLF3Q8IUI8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRLF3Q8IUI8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRLF3Q8IUI8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRLF3Q8IUI8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRLF3Q8IUI8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRLF3Q8IUI8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRLF3Q8IUI8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRLF3Q8IUI8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRLF3Q8IUI8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRLF3Q8IUI8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRLF3Q8IUI8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CRLF3Q8IUI8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRLF3Q8IUI8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRLF3Q8IUI8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CRLF3Q8IUI8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRLF3Q8IUI8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRLF3Q8IUI8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRLF3Q8IUI8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRLF3Q8IUI8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRLF3Q8IUI8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRLF3Q8IUI8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRLF3Q8IUI8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRLF3Q8IUI8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRLF3Q8IUI8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRLF3Q8IUI8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRLF3Q8IUI8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRLF3Q8IUI8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CRLF3Q8IUI8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRLF3Q8IUI8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRLF3Q8IUI8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRLF3Q8IUI8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CRLF3Q8IUI8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRLF3Q8IUI8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRLF3Q8IUI8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRLF3Q8IUI8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRLF3Q8IUI8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRLF3Q8IUI8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRLF3Q8IUI8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRLF3Q8IUI8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRLF3Q8IUI8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRLF3Q8IUI8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRLF3Q8IUI8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRLF3Q8IUI8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRLF3Q8IUI8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRLF3Q8IUI8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRLF3Q8IUI8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRLF3Q8IUI8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRLF3Q8IUI8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRLF3Q8IUI8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRLF3Q8IUI8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CRLF3Q8IUI8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CRLF3Q8IUI8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CRLF3Q8IUI8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRLF3Q8IUI8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRLF3Q8IUI8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRLF3Q8IUI8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRLF3Q8IUI8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRLF3Q8IUI8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRLF3Q8IUI8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRLF3Q8IUI8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRLF3Q8IUI8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CRLF3Q8IUI8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CRLF3Q8IUI8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRLF3Q8IUI8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRLF3Q8IUI8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRLF3Q8IUI8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRLF3Q8IUI8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRLF3Q8IUI8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRLF3Q8IUI8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRLF3Q8IUI8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRLF3Q8IUI8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRLF3Q8IUI8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRLF3Q8IUI8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms