Protein–RNA interactions for Protein: Q86UF1

TSPAN33, Tetraspanin-33, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN33Q86UF1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPAN33Q86UF1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPAN33Q86UF1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPAN33Q86UF1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPAN33Q86UF1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPAN33Q86UF1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPAN33Q86UF1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPAN33Q86UF1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPAN33Q86UF1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPAN33Q86UF1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN33Q86UF1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN33Q86UF1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN33Q86UF1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN33Q86UF1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN33Q86UF1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN33Q86UF1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPAN33Q86UF1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPAN33Q86UF1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPAN33Q86UF1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPAN33Q86UF1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TSPAN33Q86UF1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSPAN33Q86UF1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSPAN33Q86UF1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN33Q86UF1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN33Q86UF1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN33Q86UF1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN33Q86UF1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN33Q86UF1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN33Q86UF1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN33Q86UF1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN33Q86UF1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN33Q86UF1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN33Q86UF1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN33Q86UF1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN33Q86UF1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN33Q86UF1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN33Q86UF1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN33Q86UF1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN33Q86UF1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN33Q86UF1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN33Q86UF1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN33Q86UF1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN33Q86UF1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN33Q86UF1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN33Q86UF1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN33Q86UF1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN33Q86UF1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN33Q86UF1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN33Q86UF1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSPAN33Q86UF1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSPAN33Q86UF1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSPAN33Q86UF1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSPAN33Q86UF1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN33Q86UF1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN33Q86UF1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN33Q86UF1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN33Q86UF1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN33Q86UF1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN33Q86UF1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN33Q86UF1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN33Q86UF1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN33Q86UF1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN33Q86UF1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN33Q86UF1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN33Q86UF1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN33Q86UF1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN33Q86UF1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN33Q86UF1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN33Q86UF1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN33Q86UF1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN33Q86UF1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN33Q86UF1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN33Q86UF1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN33Q86UF1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN33Q86UF1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN33Q86UF1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN33Q86UF1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN33Q86UF1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN33Q86UF1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN33Q86UF1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN33Q86UF1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN33Q86UF1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSPAN33Q86UF1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN33Q86UF1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN33Q86UF1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN33Q86UF1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN33Q86UF1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN33Q86UF1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN33Q86UF1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN33Q86UF1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN33Q86UF1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN33Q86UF1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN33Q86UF1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN33Q86UF1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN33Q86UF1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN33Q86UF1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN33Q86UF1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN33Q86UF1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN33Q86UF1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSPAN33Q86UF1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms