Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
PBRM1Q86U86 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC41.23■■■■■ 4.19
PBRM1Q86U86 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC41.23■■■■■ 4.19
PBRM1Q86U86 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
PBRM1Q86U86 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
PBRM1Q86U86 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
PBRM1Q86U86 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
PBRM1Q86U86 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
PBRM1Q86U86 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
PBRM1Q86U86 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC41.19■■■■■ 4.18
PBRM1Q86U86 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC41.19■■■■■ 4.18
PBRM1Q86U86 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
PBRM1Q86U86 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC41.17■■■■■ 4.18
PBRM1Q86U86 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
PBRM1Q86U86 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
PBRM1Q86U86 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
PBRM1Q86U86 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
PBRM1Q86U86 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
PBRM1Q86U86 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
PBRM1Q86U86 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
PBRM1Q86U86 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC41.15■■■■■ 4.18
PBRM1Q86U86 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
PBRM1Q86U86 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
PBRM1Q86U86 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
PBRM1Q86U86 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
PBRM1Q86U86 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.17
PBRM1Q86U86 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC41.12■■■■■ 4.17
PBRM1Q86U86 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
PBRM1Q86U86 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
PBRM1Q86U86 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
PBRM1Q86U86 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
PBRM1Q86U86 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
PBRM1Q86U86 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
PBRM1Q86U86 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
PBRM1Q86U86 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC41.11■■■■■ 4.17
PBRM1Q86U86 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
PBRM1Q86U86 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
PBRM1Q86U86 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC41.1■■■■■ 4.17
PBRM1Q86U86 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
PBRM1Q86U86 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
PBRM1Q86U86 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
PBRM1Q86U86 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
PBRM1Q86U86 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.09■■■■■ 4.17
PBRM1Q86U86 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
PBRM1Q86U86 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC41.08■■■■■ 4.17
PBRM1Q86U86 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC41.08■■■■■ 4.17
PBRM1Q86U86 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.17
PBRM1Q86U86 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC41.07■■■■■ 4.16
PBRM1Q86U86 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
PBRM1Q86U86 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.16
PBRM1Q86U86 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.16
PBRM1Q86U86 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
PBRM1Q86U86 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
PBRM1Q86U86 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC41.06■■■■■ 4.16
PBRM1Q86U86 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.05■■■■■ 4.16
PBRM1Q86U86 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
PBRM1Q86U86 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
PBRM1Q86U86 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
PBRM1Q86U86 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
PBRM1Q86U86 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
PBRM1Q86U86 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
PBRM1Q86U86 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
PBRM1Q86U86 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
PBRM1Q86U86 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
PBRM1Q86U86 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC41.02■■■■■ 4.16
PBRM1Q86U86 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC41.02■■■■■ 4.16
PBRM1Q86U86 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
PBRM1Q86U86 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
PBRM1Q86U86 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
PBRM1Q86U86 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.15
PBRM1Q86U86 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC41.01■■■■■ 4.15
PBRM1Q86U86 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC41.01■■■■■ 4.15
PBRM1Q86U86 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
PBRM1Q86U86 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
PBRM1Q86U86 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC40.99■■■■■ 4.15
PBRM1Q86U86 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC40.98■■■■■ 4.15
PBRM1Q86U86 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
PBRM1Q86U86 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC40.97■■■■■ 4.15
PBRM1Q86U86 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC40.96■■■■■ 4.15
PBRM1Q86U86 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC40.95■■■■■ 4.15
PBRM1Q86U86 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.15
PBRM1Q86U86 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC40.94■■■■■ 4.15
PBRM1Q86U86 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.14
PBRM1Q86U86 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
PBRM1Q86U86 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
PBRM1Q86U86 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
PBRM1Q86U86 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
PBRM1Q86U86 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC40.93■■■■■ 4.14
PBRM1Q86U86 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
PBRM1Q86U86 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
PBRM1Q86U86 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
PBRM1Q86U86 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
PBRM1Q86U86 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
PBRM1Q86U86 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
PBRM1Q86U86 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
PBRM1Q86U86 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
PBRM1Q86U86 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
PBRM1Q86U86 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
PBRM1Q86U86 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
PBRM1Q86U86 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC40.89■■■■■ 4.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1188.4 ms