Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG4DQ86TL0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG4DQ86TL0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG4DQ86TL0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG4DQ86TL0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG4DQ86TL0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG4DQ86TL0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG4DQ86TL0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG4DQ86TL0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG4DQ86TL0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG4DQ86TL0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG4DQ86TL0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG4DQ86TL0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG4DQ86TL0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG4DQ86TL0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG4DQ86TL0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG4DQ86TL0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG4DQ86TL0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG4DQ86TL0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG4DQ86TL0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG4DQ86TL0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG4DQ86TL0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG4DQ86TL0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG4DQ86TL0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG4DQ86TL0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG4DQ86TL0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG4DQ86TL0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG4DQ86TL0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG4DQ86TL0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG4DQ86TL0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG4DQ86TL0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG4DQ86TL0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG4DQ86TL0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG4DQ86TL0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG4DQ86TL0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG4DQ86TL0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG4DQ86TL0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG4DQ86TL0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG4DQ86TL0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4DQ86TL0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4DQ86TL0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4DQ86TL0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4DQ86TL0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4DQ86TL0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4DQ86TL0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4DQ86TL0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4DQ86TL0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4DQ86TL0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4DQ86TL0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4DQ86TL0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG4DQ86TL0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG4DQ86TL0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG4DQ86TL0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG4DQ86TL0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG4DQ86TL0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG4DQ86TL0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG4DQ86TL0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG4DQ86TL0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG4DQ86TL0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG4DQ86TL0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG4DQ86TL0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG4DQ86TL0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG4DQ86TL0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG4DQ86TL0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG4DQ86TL0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG4DQ86TL0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG4DQ86TL0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG4DQ86TL0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG4DQ86TL0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG4DQ86TL0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG4DQ86TL0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG4DQ86TL0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG4DQ86TL0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG4DQ86TL0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG4DQ86TL0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG4DQ86TL0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG4DQ86TL0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG4DQ86TL0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG4DQ86TL0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG4DQ86TL0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG4DQ86TL0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG4DQ86TL0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG4DQ86TL0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG4DQ86TL0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG4DQ86TL0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG4DQ86TL0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG4DQ86TL0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG4DQ86TL0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG4DQ86TL0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG4DQ86TL0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG4DQ86TL0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG4DQ86TL0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG4DQ86TL0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG4DQ86TL0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG4DQ86TL0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG4DQ86TL0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG4DQ86TL0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG4DQ86TL0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG4DQ86TL0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG4DQ86TL0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms