Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z460

CLASP1, CLIP-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLASP1Q7Z460 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
CLASP1Q7Z460 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
CLASP1Q7Z460 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
CLASP1Q7Z460 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC40.67■■■■■ 4.1
CLASP1Q7Z460 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
CLASP1Q7Z460 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
CLASP1Q7Z460 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC40.66■■■■■ 4.1
CLASP1Q7Z460 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC40.66■■■■■ 4.1
CLASP1Q7Z460 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.66■■■■■ 4.1
CLASP1Q7Z460 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC40.65■■■■■ 4.1
CLASP1Q7Z460 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
CLASP1Q7Z460 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
CLASP1Q7Z460 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
CLASP1Q7Z460 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC40.63■■■■■ 4.1
CLASP1Q7Z460 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC40.63■■■■■ 4.1
CLASP1Q7Z460 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
CLASP1Q7Z460 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
CLASP1Q7Z460 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
CLASP1Q7Z460 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
CLASP1Q7Z460 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
CLASP1Q7Z460 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC40.57■■■■■ 4.09
CLASP1Q7Z460 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.09
CLASP1Q7Z460 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
CLASP1Q7Z460 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
CLASP1Q7Z460 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC40.57■■■■■ 4.08
CLASP1Q7Z460 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.56■■■■■ 4.08
CLASP1Q7Z460 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC40.56■■■■■ 4.08
CLASP1Q7Z460 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
CLASP1Q7Z460 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
CLASP1Q7Z460 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
CLASP1Q7Z460 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC40.54■■■■■ 4.08
CLASP1Q7Z460 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
CLASP1Q7Z460 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
CLASP1Q7Z460 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
CLASP1Q7Z460 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
CLASP1Q7Z460 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
CLASP1Q7Z460 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC40.52■■■■■ 4.08
CLASP1Q7Z460 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
CLASP1Q7Z460 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
CLASP1Q7Z460 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
CLASP1Q7Z460 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
CLASP1Q7Z460 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
CLASP1Q7Z460 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
CLASP1Q7Z460 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
CLASP1Q7Z460 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
CLASP1Q7Z460 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
CLASP1Q7Z460 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.49■■■■■ 4.07
CLASP1Q7Z460 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
CLASP1Q7Z460 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
CLASP1Q7Z460 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
CLASP1Q7Z460 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC40.48■■■■■ 4.07
CLASP1Q7Z460 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
CLASP1Q7Z460 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
CLASP1Q7Z460 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC40.47■■■■■ 4.07
CLASP1Q7Z460 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
CLASP1Q7Z460 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
CLASP1Q7Z460 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
CLASP1Q7Z460 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
CLASP1Q7Z460 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
CLASP1Q7Z460 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
CLASP1Q7Z460 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
CLASP1Q7Z460 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
CLASP1Q7Z460 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
CLASP1Q7Z460 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
CLASP1Q7Z460 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC40.42■■■■■ 4.06
CLASP1Q7Z460 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC40.42■■■■■ 4.06
CLASP1Q7Z460 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
CLASP1Q7Z460 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC40.42■■■■■ 4.06
CLASP1Q7Z460 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
CLASP1Q7Z460 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
CLASP1Q7Z460 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC40.41■■■■■ 4.06
CLASP1Q7Z460 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
CLASP1Q7Z460 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
CLASP1Q7Z460 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.06
CLASP1Q7Z460 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC40.38■■■■■ 4.06
CLASP1Q7Z460 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
CLASP1Q7Z460 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
CLASP1Q7Z460 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.37■■■■■ 4.05
CLASP1Q7Z460 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
CLASP1Q7Z460 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
CLASP1Q7Z460 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
CLASP1Q7Z460 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
CLASP1Q7Z460 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC40.35■■■■■ 4.05
CLASP1Q7Z460 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
CLASP1Q7Z460 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
CLASP1Q7Z460 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
CLASP1Q7Z460 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.05
CLASP1Q7Z460 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.05
CLASP1Q7Z460 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
CLASP1Q7Z460 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
CLASP1Q7Z460 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC40.32■■■■■ 4.04
CLASP1Q7Z460 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
CLASP1Q7Z460 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC40.31■■■■■ 4.04
CLASP1Q7Z460 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
CLASP1Q7Z460 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
CLASP1Q7Z460 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
CLASP1Q7Z460 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
CLASP1Q7Z460 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
CLASP1Q7Z460 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
CLASP1Q7Z460 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms