Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CATSPER4Q7RTX7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CATSPER4Q7RTX7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CATSPER4Q7RTX7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CATSPER4Q7RTX7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CATSPER4Q7RTX7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CATSPER4Q7RTX7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CATSPER4Q7RTX7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CATSPER4Q7RTX7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CATSPER4Q7RTX7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CATSPER4Q7RTX7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CATSPER4Q7RTX7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CATSPER4Q7RTX7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CATSPER4Q7RTX7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CATSPER4Q7RTX7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CATSPER4Q7RTX7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CATSPER4Q7RTX7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CATSPER4Q7RTX7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CATSPER4Q7RTX7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CATSPER4Q7RTX7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CATSPER4Q7RTX7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CATSPER4Q7RTX7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CATSPER4Q7RTX7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CATSPER4Q7RTX7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CATSPER4Q7RTX7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CATSPER4Q7RTX7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CATSPER4Q7RTX7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CATSPER4Q7RTX7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CATSPER4Q7RTX7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CATSPER4Q7RTX7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CATSPER4Q7RTX7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CATSPER4Q7RTX7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CATSPER4Q7RTX7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CATSPER4Q7RTX7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CATSPER4Q7RTX7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CATSPER4Q7RTX7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CATSPER4Q7RTX7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CATSPER4Q7RTX7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CATSPER4Q7RTX7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CATSPER4Q7RTX7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CATSPER4Q7RTX7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CATSPER4Q7RTX7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CATSPER4Q7RTX7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CATSPER4Q7RTX7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CATSPER4Q7RTX7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CATSPER4Q7RTX7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CATSPER4Q7RTX7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CATSPER4Q7RTX7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CATSPER4Q7RTX7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CATSPER4Q7RTX7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CATSPER4Q7RTX7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CATSPER4Q7RTX7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CATSPER4Q7RTX7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CATSPER4Q7RTX7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CATSPER4Q7RTX7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CATSPER4Q7RTX7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CATSPER4Q7RTX7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CATSPER4Q7RTX7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CATSPER4Q7RTX7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CATSPER4Q7RTX7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CATSPER4Q7RTX7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CATSPER4Q7RTX7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CATSPER4Q7RTX7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CATSPER4Q7RTX7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CATSPER4Q7RTX7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CATSPER4Q7RTX7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CATSPER4Q7RTX7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CATSPER4Q7RTX7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CATSPER4Q7RTX7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CATSPER4Q7RTX7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CATSPER4Q7RTX7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CATSPER4Q7RTX7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CATSPER4Q7RTX7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CATSPER4Q7RTX7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CATSPER4Q7RTX7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CATSPER4Q7RTX7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CATSPER4Q7RTX7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CATSPER4Q7RTX7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CATSPER4Q7RTX7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CATSPER4Q7RTX7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CATSPER4Q7RTX7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CATSPER4Q7RTX7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CATSPER4Q7RTX7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CATSPER4Q7RTX7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CATSPER4Q7RTX7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CATSPER4Q7RTX7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CATSPER4Q7RTX7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CATSPER4Q7RTX7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CATSPER4Q7RTX7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CATSPER4Q7RTX7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CATSPER4Q7RTX7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CATSPER4Q7RTX7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CATSPER4Q7RTX7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CATSPER4Q7RTX7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CATSPER4Q7RTX7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CATSPER4Q7RTX7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CATSPER4Q7RTX7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CATSPER4Q7RTX7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CATSPER4Q7RTX7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CATSPER4Q7RTX7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms