Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTN6

STRADA, STE20-related kinase adapter protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADAQ7RTN6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRADAQ7RTN6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRADAQ7RTN6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRADAQ7RTN6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRADAQ7RTN6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
STRADAQ7RTN6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRADAQ7RTN6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRADAQ7RTN6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRADAQ7RTN6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRADAQ7RTN6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRADAQ7RTN6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRADAQ7RTN6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRADAQ7RTN6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRADAQ7RTN6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRADAQ7RTN6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
STRADAQ7RTN6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRADAQ7RTN6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRADAQ7RTN6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
STRADAQ7RTN6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRADAQ7RTN6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRADAQ7RTN6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRADAQ7RTN6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRADAQ7RTN6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRADAQ7RTN6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRADAQ7RTN6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRADAQ7RTN6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRADAQ7RTN6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRADAQ7RTN6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRADAQ7RTN6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRADAQ7RTN6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRADAQ7RTN6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRADAQ7RTN6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRADAQ7RTN6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRADAQ7RTN6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRADAQ7RTN6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRADAQ7RTN6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRADAQ7RTN6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRADAQ7RTN6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRADAQ7RTN6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRADAQ7RTN6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRADAQ7RTN6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRADAQ7RTN6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRADAQ7RTN6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRADAQ7RTN6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRADAQ7RTN6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRADAQ7RTN6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRADAQ7RTN6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRADAQ7RTN6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRADAQ7RTN6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRADAQ7RTN6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRADAQ7RTN6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRADAQ7RTN6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRADAQ7RTN6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRADAQ7RTN6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRADAQ7RTN6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRADAQ7RTN6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
STRADAQ7RTN6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRADAQ7RTN6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRADAQ7RTN6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRADAQ7RTN6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRADAQ7RTN6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
STRADAQ7RTN6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
STRADAQ7RTN6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
STRADAQ7RTN6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
STRADAQ7RTN6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
STRADAQ7RTN6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
STRADAQ7RTN6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
STRADAQ7RTN6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
STRADAQ7RTN6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
STRADAQ7RTN6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
STRADAQ7RTN6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
STRADAQ7RTN6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
STRADAQ7RTN6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
STRADAQ7RTN6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
STRADAQ7RTN6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
STRADAQ7RTN6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
STRADAQ7RTN6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
STRADAQ7RTN6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
STRADAQ7RTN6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
STRADAQ7RTN6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
STRADAQ7RTN6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
STRADAQ7RTN6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
STRADAQ7RTN6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
STRADAQ7RTN6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
STRADAQ7RTN6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
STRADAQ7RTN6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
STRADAQ7RTN6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
STRADAQ7RTN6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
STRADAQ7RTN6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
STRADAQ7RTN6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
STRADAQ7RTN6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
STRADAQ7RTN6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRADAQ7RTN6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRADAQ7RTN6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
STRADAQ7RTN6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRADAQ7RTN6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRADAQ7RTN6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRADAQ7RTN6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRADAQ7RTN6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRADAQ7RTN6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136 ms