Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUF6

LINC00336, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00336, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00336Q6ZUF6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00336Q6ZUF6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00336Q6ZUF6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00336Q6ZUF6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00336Q6ZUF6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00336Q6ZUF6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00336Q6ZUF6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00336Q6ZUF6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00336Q6ZUF6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00336Q6ZUF6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00336Q6ZUF6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00336Q6ZUF6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00336Q6ZUF6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00336Q6ZUF6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00336Q6ZUF6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00336Q6ZUF6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00336Q6ZUF6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00336Q6ZUF6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00336Q6ZUF6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00336Q6ZUF6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00336Q6ZUF6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00336Q6ZUF6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00336Q6ZUF6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00336Q6ZUF6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00336Q6ZUF6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00336Q6ZUF6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00336Q6ZUF6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00336Q6ZUF6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00336Q6ZUF6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00336Q6ZUF6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00336Q6ZUF6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00336Q6ZUF6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00336Q6ZUF6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00336Q6ZUF6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00336Q6ZUF6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00336Q6ZUF6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00336Q6ZUF6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00336Q6ZUF6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00336Q6ZUF6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00336Q6ZUF6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00336Q6ZUF6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00336Q6ZUF6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00336Q6ZUF6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC00336Q6ZUF6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00336Q6ZUF6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00336Q6ZUF6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00336Q6ZUF6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00336Q6ZUF6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00336Q6ZUF6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00336Q6ZUF6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00336Q6ZUF6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00336Q6ZUF6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00336Q6ZUF6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00336Q6ZUF6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00336Q6ZUF6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00336Q6ZUF6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00336Q6ZUF6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00336Q6ZUF6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00336Q6ZUF6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00336Q6ZUF6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00336Q6ZUF6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00336Q6ZUF6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00336Q6ZUF6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00336Q6ZUF6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00336Q6ZUF6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00336Q6ZUF6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00336Q6ZUF6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00336Q6ZUF6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00336Q6ZUF6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00336Q6ZUF6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00336Q6ZUF6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00336Q6ZUF6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00336Q6ZUF6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00336Q6ZUF6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00336Q6ZUF6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
LINC00336Q6ZUF6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00336Q6ZUF6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00336Q6ZUF6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00336Q6ZUF6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00336Q6ZUF6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00336Q6ZUF6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00336Q6ZUF6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00336Q6ZUF6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00336Q6ZUF6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00336Q6ZUF6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00336Q6ZUF6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00336Q6ZUF6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00336Q6ZUF6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00336Q6ZUF6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00336Q6ZUF6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00336Q6ZUF6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00336Q6ZUF6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00336Q6ZUF6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00336Q6ZUF6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00336Q6ZUF6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00336Q6ZUF6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00336Q6ZUF6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00336Q6ZUF6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00336Q6ZUF6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00336Q6ZUF6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms