Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSY5

PPP1R3F, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3FQ6ZSY5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PPP1R3FQ6ZSY5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PPP1R3FQ6ZSY5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PPP1R3FQ6ZSY5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PPP1R3FQ6ZSY5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PPP1R3FQ6ZSY5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PPP1R3FQ6ZSY5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PPP1R3FQ6ZSY5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PPP1R3FQ6ZSY5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PPP1R3FQ6ZSY5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PPP1R3FQ6ZSY5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PPP1R3FQ6ZSY5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PPP1R3FQ6ZSY5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PPP1R3FQ6ZSY5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PPP1R3FQ6ZSY5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PPP1R3FQ6ZSY5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PPP1R3FQ6ZSY5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PPP1R3FQ6ZSY5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PPP1R3FQ6ZSY5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PPP1R3FQ6ZSY5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PPP1R3FQ6ZSY5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PPP1R3FQ6ZSY5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PPP1R3FQ6ZSY5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PPP1R3FQ6ZSY5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PPP1R3FQ6ZSY5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PPP1R3FQ6ZSY5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PPP1R3FQ6ZSY5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPP1R3FQ6ZSY5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PPP1R3FQ6ZSY5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPP1R3FQ6ZSY5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PPP1R3FQ6ZSY5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPP1R3FQ6ZSY5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPP1R3FQ6ZSY5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPP1R3FQ6ZSY5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPP1R3FQ6ZSY5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPP1R3FQ6ZSY5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PPP1R3FQ6ZSY5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPP1R3FQ6ZSY5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PPP1R3FQ6ZSY5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPP1R3FQ6ZSY5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPP1R3FQ6ZSY5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPP1R3FQ6ZSY5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPP1R3FQ6ZSY5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPP1R3FQ6ZSY5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPP1R3FQ6ZSY5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPP1R3FQ6ZSY5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPP1R3FQ6ZSY5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPP1R3FQ6ZSY5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPP1R3FQ6ZSY5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PPP1R3FQ6ZSY5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPP1R3FQ6ZSY5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPP1R3FQ6ZSY5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPP1R3FQ6ZSY5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPP1R3FQ6ZSY5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPP1R3FQ6ZSY5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPP1R3FQ6ZSY5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPP1R3FQ6ZSY5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPP1R3FQ6ZSY5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPP1R3FQ6ZSY5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPP1R3FQ6ZSY5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPP1R3FQ6ZSY5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPP1R3FQ6ZSY5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPP1R3FQ6ZSY5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPP1R3FQ6ZSY5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPP1R3FQ6ZSY5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPP1R3FQ6ZSY5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPP1R3FQ6ZSY5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PPP1R3FQ6ZSY5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPP1R3FQ6ZSY5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPP1R3FQ6ZSY5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPP1R3FQ6ZSY5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPP1R3FQ6ZSY5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPP1R3FQ6ZSY5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPP1R3FQ6ZSY5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPP1R3FQ6ZSY5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PPP1R3FQ6ZSY5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PPP1R3FQ6ZSY5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
PPP1R3FQ6ZSY5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
PPP1R3FQ6ZSY5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PPP1R3FQ6ZSY5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PPP1R3FQ6ZSY5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PPP1R3FQ6ZSY5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PPP1R3FQ6ZSY5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PPP1R3FQ6ZSY5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPP1R3FQ6ZSY5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPP1R3FQ6ZSY5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPP1R3FQ6ZSY5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPP1R3FQ6ZSY5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPP1R3FQ6ZSY5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPP1R3FQ6ZSY5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPP1R3FQ6ZSY5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPP1R3FQ6ZSY5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPP1R3FQ6ZSY5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PPP1R3FQ6ZSY5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPP1R3FQ6ZSY5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPP1R3FQ6ZSY5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPP1R3FQ6ZSY5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPP1R3FQ6ZSY5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPP1R3FQ6ZSY5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPP1R3FQ6ZSY5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms