Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMD2

SPNS3, Protein spinster homolog 3, humanhuman

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Length 512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3Q6ZMD2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SPNS3Q6ZMD2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SPNS3Q6ZMD2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPNS3Q6ZMD2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPNS3Q6ZMD2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPNS3Q6ZMD2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPNS3Q6ZMD2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SPNS3Q6ZMD2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPNS3Q6ZMD2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPNS3Q6ZMD2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPNS3Q6ZMD2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPNS3Q6ZMD2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPNS3Q6ZMD2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPNS3Q6ZMD2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPNS3Q6ZMD2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPNS3Q6ZMD2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPNS3Q6ZMD2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPNS3Q6ZMD2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPNS3Q6ZMD2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SPNS3Q6ZMD2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPNS3Q6ZMD2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPNS3Q6ZMD2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPNS3Q6ZMD2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPNS3Q6ZMD2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPNS3Q6ZMD2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPNS3Q6ZMD2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPNS3Q6ZMD2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SPNS3Q6ZMD2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPNS3Q6ZMD2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPNS3Q6ZMD2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPNS3Q6ZMD2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPNS3Q6ZMD2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPNS3Q6ZMD2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPNS3Q6ZMD2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPNS3Q6ZMD2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SPNS3Q6ZMD2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPNS3Q6ZMD2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPNS3Q6ZMD2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPNS3Q6ZMD2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPNS3Q6ZMD2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SPNS3Q6ZMD2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPNS3Q6ZMD2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPNS3Q6ZMD2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPNS3Q6ZMD2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPNS3Q6ZMD2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPNS3Q6ZMD2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPNS3Q6ZMD2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPNS3Q6ZMD2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPNS3Q6ZMD2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPNS3Q6ZMD2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPNS3Q6ZMD2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPNS3Q6ZMD2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPNS3Q6ZMD2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPNS3Q6ZMD2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPNS3Q6ZMD2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPNS3Q6ZMD2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SPNS3Q6ZMD2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPNS3Q6ZMD2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPNS3Q6ZMD2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPNS3Q6ZMD2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPNS3Q6ZMD2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPNS3Q6ZMD2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPNS3Q6ZMD2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SPNS3Q6ZMD2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPNS3Q6ZMD2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPNS3Q6ZMD2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPNS3Q6ZMD2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPNS3Q6ZMD2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPNS3Q6ZMD2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPNS3Q6ZMD2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPNS3Q6ZMD2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPNS3Q6ZMD2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPNS3Q6ZMD2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPNS3Q6ZMD2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPNS3Q6ZMD2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPNS3Q6ZMD2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPNS3Q6ZMD2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPNS3Q6ZMD2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPNS3Q6ZMD2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SPNS3Q6ZMD2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPNS3Q6ZMD2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPNS3Q6ZMD2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPNS3Q6ZMD2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPNS3Q6ZMD2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPNS3Q6ZMD2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SPNS3Q6ZMD2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SPNS3Q6ZMD2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPNS3Q6ZMD2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPNS3Q6ZMD2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPNS3Q6ZMD2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPNS3Q6ZMD2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SPNS3Q6ZMD2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPNS3Q6ZMD2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPNS3Q6ZMD2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPNS3Q6ZMD2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPNS3Q6ZMD2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPNS3Q6ZMD2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPNS3Q6ZMD2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPNS3Q6ZMD2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPNS3Q6ZMD2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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