Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HACD2Q6Y1H2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HACD2Q6Y1H2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HACD2Q6Y1H2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HACD2Q6Y1H2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACD2Q6Y1H2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACD2Q6Y1H2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACD2Q6Y1H2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACD2Q6Y1H2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACD2Q6Y1H2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACD2Q6Y1H2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACD2Q6Y1H2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACD2Q6Y1H2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACD2Q6Y1H2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACD2Q6Y1H2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HACD2Q6Y1H2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HACD2Q6Y1H2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HACD2Q6Y1H2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HACD2Q6Y1H2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HACD2Q6Y1H2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HACD2Q6Y1H2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HACD2Q6Y1H2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HACD2Q6Y1H2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HACD2Q6Y1H2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HACD2Q6Y1H2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HACD2Q6Y1H2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACD2Q6Y1H2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HACD2Q6Y1H2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACD2Q6Y1H2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACD2Q6Y1H2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACD2Q6Y1H2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACD2Q6Y1H2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACD2Q6Y1H2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACD2Q6Y1H2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HACD2Q6Y1H2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HACD2Q6Y1H2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HACD2Q6Y1H2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HACD2Q6Y1H2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HACD2Q6Y1H2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HACD2Q6Y1H2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HACD2Q6Y1H2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HACD2Q6Y1H2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HACD2Q6Y1H2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HACD2Q6Y1H2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HACD2Q6Y1H2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HACD2Q6Y1H2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HACD2Q6Y1H2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HACD2Q6Y1H2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HACD2Q6Y1H2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HACD2Q6Y1H2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HACD2Q6Y1H2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HACD2Q6Y1H2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HACD2Q6Y1H2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HACD2Q6Y1H2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HACD2Q6Y1H2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HACD2Q6Y1H2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HACD2Q6Y1H2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HACD2Q6Y1H2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HACD2Q6Y1H2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HACD2Q6Y1H2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HACD2Q6Y1H2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HACD2Q6Y1H2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HACD2Q6Y1H2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HACD2Q6Y1H2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HACD2Q6Y1H2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HACD2Q6Y1H2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HACD2Q6Y1H2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACD2Q6Y1H2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACD2Q6Y1H2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACD2Q6Y1H2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACD2Q6Y1H2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HACD2Q6Y1H2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HACD2Q6Y1H2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HACD2Q6Y1H2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACD2Q6Y1H2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACD2Q6Y1H2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACD2Q6Y1H2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACD2Q6Y1H2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACD2Q6Y1H2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACD2Q6Y1H2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACD2Q6Y1H2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACD2Q6Y1H2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACD2Q6Y1H2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACD2Q6Y1H2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACD2Q6Y1H2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACD2Q6Y1H2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACD2Q6Y1H2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACD2Q6Y1H2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACD2Q6Y1H2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HACD2Q6Y1H2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HACD2Q6Y1H2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HACD2Q6Y1H2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HACD2Q6Y1H2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HACD2Q6Y1H2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HACD2Q6Y1H2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACD2Q6Y1H2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACD2Q6Y1H2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACD2Q6Y1H2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACD2Q6Y1H2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACD2Q6Y1H2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.6 ms