Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4W1

NSMF, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMFQ6X4W1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NSMFQ6X4W1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NSMFQ6X4W1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NSMFQ6X4W1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NSMFQ6X4W1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NSMFQ6X4W1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NSMFQ6X4W1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NSMFQ6X4W1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NSMFQ6X4W1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NSMFQ6X4W1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NSMFQ6X4W1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NSMFQ6X4W1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NSMFQ6X4W1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NSMFQ6X4W1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NSMFQ6X4W1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NSMFQ6X4W1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NSMFQ6X4W1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NSMFQ6X4W1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NSMFQ6X4W1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NSMFQ6X4W1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
NSMFQ6X4W1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NSMFQ6X4W1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NSMFQ6X4W1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NSMFQ6X4W1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NSMFQ6X4W1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NSMFQ6X4W1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NSMFQ6X4W1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NSMFQ6X4W1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NSMFQ6X4W1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NSMFQ6X4W1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NSMFQ6X4W1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NSMFQ6X4W1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NSMFQ6X4W1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NSMFQ6X4W1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NSMFQ6X4W1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NSMFQ6X4W1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NSMFQ6X4W1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NSMFQ6X4W1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NSMFQ6X4W1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NSMFQ6X4W1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NSMFQ6X4W1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NSMFQ6X4W1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NSMFQ6X4W1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NSMFQ6X4W1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NSMFQ6X4W1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NSMFQ6X4W1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NSMFQ6X4W1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NSMFQ6X4W1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NSMFQ6X4W1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NSMFQ6X4W1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NSMFQ6X4W1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NSMFQ6X4W1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NSMFQ6X4W1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NSMFQ6X4W1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NSMFQ6X4W1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NSMFQ6X4W1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NSMFQ6X4W1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NSMFQ6X4W1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NSMFQ6X4W1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NSMFQ6X4W1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NSMFQ6X4W1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NSMFQ6X4W1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NSMFQ6X4W1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NSMFQ6X4W1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NSMFQ6X4W1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NSMFQ6X4W1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NSMFQ6X4W1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NSMFQ6X4W1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NSMFQ6X4W1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
NSMFQ6X4W1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NSMFQ6X4W1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NSMFQ6X4W1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NSMFQ6X4W1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NSMFQ6X4W1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NSMFQ6X4W1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NSMFQ6X4W1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NSMFQ6X4W1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NSMFQ6X4W1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NSMFQ6X4W1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NSMFQ6X4W1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NSMFQ6X4W1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NSMFQ6X4W1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NSMFQ6X4W1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NSMFQ6X4W1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NSMFQ6X4W1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NSMFQ6X4W1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NSMFQ6X4W1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NSMFQ6X4W1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NSMFQ6X4W1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NSMFQ6X4W1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NSMFQ6X4W1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NSMFQ6X4W1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NSMFQ6X4W1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NSMFQ6X4W1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NSMFQ6X4W1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NSMFQ6X4W1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NSMFQ6X4W1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NSMFQ6X4W1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NSMFQ6X4W1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NSMFQ6X4W1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms