Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C1

SLC25A47, Solute carrier family 25 member 47, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A47Q6Q0C1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC25A47Q6Q0C1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC25A47Q6Q0C1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC25A47Q6Q0C1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SLC25A47Q6Q0C1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC25A47Q6Q0C1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC25A47Q6Q0C1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC25A47Q6Q0C1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC25A47Q6Q0C1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC25A47Q6Q0C1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC25A47Q6Q0C1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC25A47Q6Q0C1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC25A47Q6Q0C1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC25A47Q6Q0C1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC25A47Q6Q0C1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC25A47Q6Q0C1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC25A47Q6Q0C1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC25A47Q6Q0C1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC25A47Q6Q0C1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC25A47Q6Q0C1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC25A47Q6Q0C1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC25A47Q6Q0C1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC25A47Q6Q0C1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC25A47Q6Q0C1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC25A47Q6Q0C1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC25A47Q6Q0C1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC25A47Q6Q0C1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC25A47Q6Q0C1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC25A47Q6Q0C1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC25A47Q6Q0C1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC25A47Q6Q0C1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC25A47Q6Q0C1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC25A47Q6Q0C1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC25A47Q6Q0C1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC25A47Q6Q0C1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC25A47Q6Q0C1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC25A47Q6Q0C1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC25A47Q6Q0C1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC25A47Q6Q0C1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC25A47Q6Q0C1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC25A47Q6Q0C1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC25A47Q6Q0C1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC25A47Q6Q0C1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC25A47Q6Q0C1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC25A47Q6Q0C1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC25A47Q6Q0C1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC25A47Q6Q0C1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC25A47Q6Q0C1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC25A47Q6Q0C1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC25A47Q6Q0C1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC25A47Q6Q0C1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC25A47Q6Q0C1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC25A47Q6Q0C1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC25A47Q6Q0C1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC25A47Q6Q0C1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC25A47Q6Q0C1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC25A47Q6Q0C1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC25A47Q6Q0C1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC25A47Q6Q0C1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC25A47Q6Q0C1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC25A47Q6Q0C1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC25A47Q6Q0C1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC25A47Q6Q0C1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC25A47Q6Q0C1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC25A47Q6Q0C1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC25A47Q6Q0C1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC25A47Q6Q0C1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC25A47Q6Q0C1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC25A47Q6Q0C1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC25A47Q6Q0C1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC25A47Q6Q0C1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC25A47Q6Q0C1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC25A47Q6Q0C1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC25A47Q6Q0C1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC25A47Q6Q0C1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC25A47Q6Q0C1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC25A47Q6Q0C1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC25A47Q6Q0C1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC25A47Q6Q0C1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC25A47Q6Q0C1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC25A47Q6Q0C1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC25A47Q6Q0C1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC25A47Q6Q0C1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC25A47Q6Q0C1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC25A47Q6Q0C1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC25A47Q6Q0C1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC25A47Q6Q0C1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC25A47Q6Q0C1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC25A47Q6Q0C1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC25A47Q6Q0C1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC25A47Q6Q0C1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC25A47Q6Q0C1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC25A47Q6Q0C1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC25A47Q6Q0C1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC25A47Q6Q0C1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC25A47Q6Q0C1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC25A47Q6Q0C1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC25A47Q6Q0C1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms