Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJG6

BRAT1, BRCA1-associated ATM activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAT1Q6PJG6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRAT1Q6PJG6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRAT1Q6PJG6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRAT1Q6PJG6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRAT1Q6PJG6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRAT1Q6PJG6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRAT1Q6PJG6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRAT1Q6PJG6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BRAT1Q6PJG6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRAT1Q6PJG6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRAT1Q6PJG6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRAT1Q6PJG6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRAT1Q6PJG6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
BRAT1Q6PJG6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
BRAT1Q6PJG6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRAT1Q6PJG6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRAT1Q6PJG6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRAT1Q6PJG6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRAT1Q6PJG6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRAT1Q6PJG6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRAT1Q6PJG6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRAT1Q6PJG6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRAT1Q6PJG6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRAT1Q6PJG6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRAT1Q6PJG6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRAT1Q6PJG6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRAT1Q6PJG6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
BRAT1Q6PJG6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRAT1Q6PJG6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
BRAT1Q6PJG6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRAT1Q6PJG6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRAT1Q6PJG6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRAT1Q6PJG6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRAT1Q6PJG6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRAT1Q6PJG6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRAT1Q6PJG6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRAT1Q6PJG6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
BRAT1Q6PJG6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRAT1Q6PJG6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
BRAT1Q6PJG6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRAT1Q6PJG6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRAT1Q6PJG6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRAT1Q6PJG6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRAT1Q6PJG6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
BRAT1Q6PJG6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRAT1Q6PJG6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRAT1Q6PJG6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRAT1Q6PJG6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRAT1Q6PJG6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRAT1Q6PJG6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRAT1Q6PJG6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRAT1Q6PJG6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
BRAT1Q6PJG6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRAT1Q6PJG6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRAT1Q6PJG6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRAT1Q6PJG6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRAT1Q6PJG6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRAT1Q6PJG6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRAT1Q6PJG6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRAT1Q6PJG6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BRAT1Q6PJG6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRAT1Q6PJG6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRAT1Q6PJG6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRAT1Q6PJG6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRAT1Q6PJG6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRAT1Q6PJG6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRAT1Q6PJG6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRAT1Q6PJG6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRAT1Q6PJG6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
BRAT1Q6PJG6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRAT1Q6PJG6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRAT1Q6PJG6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRAT1Q6PJG6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRAT1Q6PJG6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRAT1Q6PJG6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRAT1Q6PJG6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRAT1Q6PJG6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRAT1Q6PJG6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRAT1Q6PJG6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRAT1Q6PJG6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRAT1Q6PJG6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRAT1Q6PJG6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRAT1Q6PJG6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRAT1Q6PJG6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRAT1Q6PJG6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRAT1Q6PJG6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRAT1Q6PJG6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRAT1Q6PJG6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRAT1Q6PJG6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRAT1Q6PJG6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRAT1Q6PJG6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRAT1Q6PJG6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRAT1Q6PJG6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BRAT1Q6PJG6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRAT1Q6PJG6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRAT1Q6PJG6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRAT1Q6PJG6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRAT1Q6PJG6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BRAT1Q6PJG6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRAT1Q6PJG6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms