Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF549Q6P9A3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF549Q6P9A3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF549Q6P9A3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF549Q6P9A3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF549Q6P9A3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF549Q6P9A3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF549Q6P9A3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF549Q6P9A3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF549Q6P9A3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF549Q6P9A3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF549Q6P9A3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF549Q6P9A3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF549Q6P9A3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF549Q6P9A3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF549Q6P9A3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF549Q6P9A3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF549Q6P9A3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF549Q6P9A3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF549Q6P9A3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF549Q6P9A3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF549Q6P9A3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF549Q6P9A3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF549Q6P9A3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF549Q6P9A3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF549Q6P9A3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF549Q6P9A3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF549Q6P9A3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF549Q6P9A3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF549Q6P9A3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF549Q6P9A3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF549Q6P9A3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF549Q6P9A3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF549Q6P9A3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF549Q6P9A3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF549Q6P9A3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF549Q6P9A3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF549Q6P9A3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF549Q6P9A3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF549Q6P9A3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF549Q6P9A3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF549Q6P9A3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF549Q6P9A3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF549Q6P9A3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF549Q6P9A3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF549Q6P9A3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF549Q6P9A3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF549Q6P9A3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF549Q6P9A3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF549Q6P9A3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF549Q6P9A3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF549Q6P9A3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF549Q6P9A3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF549Q6P9A3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF549Q6P9A3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF549Q6P9A3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF549Q6P9A3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF549Q6P9A3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF549Q6P9A3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF549Q6P9A3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF549Q6P9A3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF549Q6P9A3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF549Q6P9A3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF549Q6P9A3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF549Q6P9A3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF549Q6P9A3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF549Q6P9A3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF549Q6P9A3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF549Q6P9A3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF549Q6P9A3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF549Q6P9A3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF549Q6P9A3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF549Q6P9A3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF549Q6P9A3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF549Q6P9A3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF549Q6P9A3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF549Q6P9A3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF549Q6P9A3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF549Q6P9A3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF549Q6P9A3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF549Q6P9A3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF549Q6P9A3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF549Q6P9A3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF549Q6P9A3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF549Q6P9A3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF549Q6P9A3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF549Q6P9A3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF549Q6P9A3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF549Q6P9A3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF549Q6P9A3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF549Q6P9A3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF549Q6P9A3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF549Q6P9A3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNF549Q6P9A3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF549Q6P9A3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF549Q6P9A3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF549Q6P9A3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF549Q6P9A3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF549Q6P9A3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF549Q6P9A3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms