Protein–RNA interactions for Protein: Q6P087

RPUSD3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase RPUSD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD3Q6P087 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RPUSD3Q6P087 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RPUSD3Q6P087 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPUSD3Q6P087 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPUSD3Q6P087 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPUSD3Q6P087 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPUSD3Q6P087 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RPUSD3Q6P087 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPUSD3Q6P087 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPUSD3Q6P087 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPUSD3Q6P087 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RPUSD3Q6P087 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPUSD3Q6P087 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPUSD3Q6P087 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPUSD3Q6P087 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPUSD3Q6P087 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPUSD3Q6P087 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPUSD3Q6P087 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RPUSD3Q6P087 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPUSD3Q6P087 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPUSD3Q6P087 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPUSD3Q6P087 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RPUSD3Q6P087 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPUSD3Q6P087 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPUSD3Q6P087 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPUSD3Q6P087 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RPUSD3Q6P087 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPUSD3Q6P087 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPUSD3Q6P087 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPUSD3Q6P087 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPUSD3Q6P087 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPUSD3Q6P087 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPUSD3Q6P087 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPUSD3Q6P087 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPUSD3Q6P087 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPUSD3Q6P087 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPUSD3Q6P087 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPUSD3Q6P087 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPUSD3Q6P087 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPUSD3Q6P087 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPUSD3Q6P087 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPUSD3Q6P087 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPUSD3Q6P087 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPUSD3Q6P087 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPUSD3Q6P087 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPUSD3Q6P087 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPUSD3Q6P087 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPUSD3Q6P087 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPUSD3Q6P087 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPUSD3Q6P087 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RPUSD3Q6P087 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPUSD3Q6P087 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPUSD3Q6P087 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPUSD3Q6P087 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPUSD3Q6P087 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPUSD3Q6P087 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPUSD3Q6P087 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPUSD3Q6P087 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPUSD3Q6P087 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPUSD3Q6P087 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPUSD3Q6P087 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPUSD3Q6P087 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPUSD3Q6P087 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPUSD3Q6P087 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPUSD3Q6P087 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPUSD3Q6P087 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPUSD3Q6P087 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RPUSD3Q6P087 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPUSD3Q6P087 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPUSD3Q6P087 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPUSD3Q6P087 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RPUSD3Q6P087 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPUSD3Q6P087 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPUSD3Q6P087 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPUSD3Q6P087 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RPUSD3Q6P087 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPUSD3Q6P087 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPUSD3Q6P087 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPUSD3Q6P087 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RPUSD3Q6P087 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPUSD3Q6P087 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPUSD3Q6P087 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPUSD3Q6P087 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPUSD3Q6P087 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPUSD3Q6P087 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPUSD3Q6P087 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPUSD3Q6P087 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPUSD3Q6P087 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPUSD3Q6P087 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPUSD3Q6P087 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPUSD3Q6P087 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPUSD3Q6P087 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPUSD3Q6P087 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPUSD3Q6P087 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPUSD3Q6P087 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPUSD3Q6P087 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPUSD3Q6P087 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPUSD3Q6P087 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPUSD3Q6P087 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPUSD3Q6P087 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms