Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EFCAB12Q6NXP0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EFCAB12Q6NXP0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EFCAB12Q6NXP0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EFCAB12Q6NXP0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EFCAB12Q6NXP0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EFCAB12Q6NXP0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EFCAB12Q6NXP0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EFCAB12Q6NXP0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EFCAB12Q6NXP0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
EFCAB12Q6NXP0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EFCAB12Q6NXP0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EFCAB12Q6NXP0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EFCAB12Q6NXP0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EFCAB12Q6NXP0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EFCAB12Q6NXP0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EFCAB12Q6NXP0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EFCAB12Q6NXP0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EFCAB12Q6NXP0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EFCAB12Q6NXP0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EFCAB12Q6NXP0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EFCAB12Q6NXP0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EFCAB12Q6NXP0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EFCAB12Q6NXP0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EFCAB12Q6NXP0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EFCAB12Q6NXP0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EFCAB12Q6NXP0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
EFCAB12Q6NXP0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EFCAB12Q6NXP0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
EFCAB12Q6NXP0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EFCAB12Q6NXP0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EFCAB12Q6NXP0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EFCAB12Q6NXP0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
EFCAB12Q6NXP0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EFCAB12Q6NXP0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EFCAB12Q6NXP0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EFCAB12Q6NXP0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EFCAB12Q6NXP0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EFCAB12Q6NXP0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EFCAB12Q6NXP0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EFCAB12Q6NXP0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EFCAB12Q6NXP0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EFCAB12Q6NXP0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EFCAB12Q6NXP0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EFCAB12Q6NXP0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EFCAB12Q6NXP0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EFCAB12Q6NXP0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EFCAB12Q6NXP0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EFCAB12Q6NXP0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EFCAB12Q6NXP0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EFCAB12Q6NXP0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
EFCAB12Q6NXP0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EFCAB12Q6NXP0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EFCAB12Q6NXP0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EFCAB12Q6NXP0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EFCAB12Q6NXP0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
EFCAB12Q6NXP0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EFCAB12Q6NXP0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EFCAB12Q6NXP0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
EFCAB12Q6NXP0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EFCAB12Q6NXP0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EFCAB12Q6NXP0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EFCAB12Q6NXP0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EFCAB12Q6NXP0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
EFCAB12Q6NXP0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EFCAB12Q6NXP0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EFCAB12Q6NXP0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EFCAB12Q6NXP0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EFCAB12Q6NXP0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EFCAB12Q6NXP0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EFCAB12Q6NXP0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EFCAB12Q6NXP0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EFCAB12Q6NXP0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EFCAB12Q6NXP0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EFCAB12Q6NXP0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EFCAB12Q6NXP0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EFCAB12Q6NXP0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EFCAB12Q6NXP0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EFCAB12Q6NXP0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EFCAB12Q6NXP0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EFCAB12Q6NXP0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EFCAB12Q6NXP0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EFCAB12Q6NXP0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EFCAB12Q6NXP0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EFCAB12Q6NXP0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EFCAB12Q6NXP0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EFCAB12Q6NXP0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EFCAB12Q6NXP0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EFCAB12Q6NXP0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EFCAB12Q6NXP0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EFCAB12Q6NXP0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EFCAB12Q6NXP0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EFCAB12Q6NXP0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EFCAB12Q6NXP0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EFCAB12Q6NXP0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EFCAB12Q6NXP0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EFCAB12Q6NXP0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EFCAB12Q6NXP0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EFCAB12Q6NXP0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EFCAB12Q6NXP0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.8 ms