Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RWDD4Q6NW29 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RWDD4Q6NW29 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RWDD4Q6NW29 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RWDD4Q6NW29 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RWDD4Q6NW29 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RWDD4Q6NW29 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RWDD4Q6NW29 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RWDD4Q6NW29 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RWDD4Q6NW29 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RWDD4Q6NW29 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RWDD4Q6NW29 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RWDD4Q6NW29 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RWDD4Q6NW29 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RWDD4Q6NW29 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RWDD4Q6NW29 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RWDD4Q6NW29 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RWDD4Q6NW29 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RWDD4Q6NW29 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RWDD4Q6NW29 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RWDD4Q6NW29 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RWDD4Q6NW29 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RWDD4Q6NW29 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RWDD4Q6NW29 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RWDD4Q6NW29 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RWDD4Q6NW29 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RWDD4Q6NW29 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RWDD4Q6NW29 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RWDD4Q6NW29 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RWDD4Q6NW29 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RWDD4Q6NW29 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RWDD4Q6NW29 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RWDD4Q6NW29 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RWDD4Q6NW29 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RWDD4Q6NW29 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RWDD4Q6NW29 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RWDD4Q6NW29 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RWDD4Q6NW29 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RWDD4Q6NW29 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RWDD4Q6NW29 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RWDD4Q6NW29 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RWDD4Q6NW29 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RWDD4Q6NW29 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RWDD4Q6NW29 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RWDD4Q6NW29 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RWDD4Q6NW29 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RWDD4Q6NW29 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RWDD4Q6NW29 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RWDD4Q6NW29 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RWDD4Q6NW29 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RWDD4Q6NW29 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RWDD4Q6NW29 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RWDD4Q6NW29 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RWDD4Q6NW29 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RWDD4Q6NW29 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RWDD4Q6NW29 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RWDD4Q6NW29 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RWDD4Q6NW29 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RWDD4Q6NW29 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RWDD4Q6NW29 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RWDD4Q6NW29 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RWDD4Q6NW29 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RWDD4Q6NW29 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RWDD4Q6NW29 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RWDD4Q6NW29 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RWDD4Q6NW29 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RWDD4Q6NW29 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RWDD4Q6NW29 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RWDD4Q6NW29 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RWDD4Q6NW29 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RWDD4Q6NW29 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RWDD4Q6NW29 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RWDD4Q6NW29 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RWDD4Q6NW29 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RWDD4Q6NW29 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RWDD4Q6NW29 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RWDD4Q6NW29 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RWDD4Q6NW29 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RWDD4Q6NW29 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RWDD4Q6NW29 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RWDD4Q6NW29 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RWDD4Q6NW29 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RWDD4Q6NW29 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RWDD4Q6NW29 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RWDD4Q6NW29 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RWDD4Q6NW29 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RWDD4Q6NW29 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RWDD4Q6NW29 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RWDD4Q6NW29 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RWDD4Q6NW29 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RWDD4Q6NW29 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RWDD4Q6NW29 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RWDD4Q6NW29 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RWDD4Q6NW29 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RWDD4Q6NW29 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RWDD4Q6NW29 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RWDD4Q6NW29 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RWDD4Q6NW29 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RWDD4Q6NW29 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RWDD4Q6NW29 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms