Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF9

RHBDD2, Rhomboid domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2Q6NTF9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDD2Q6NTF9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDD2Q6NTF9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDD2Q6NTF9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDD2Q6NTF9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDD2Q6NTF9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDD2Q6NTF9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDD2Q6NTF9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDD2Q6NTF9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDD2Q6NTF9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDD2Q6NTF9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDD2Q6NTF9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDD2Q6NTF9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDD2Q6NTF9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDD2Q6NTF9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDD2Q6NTF9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDD2Q6NTF9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDD2Q6NTF9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDD2Q6NTF9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDD2Q6NTF9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDD2Q6NTF9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDD2Q6NTF9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDD2Q6NTF9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDD2Q6NTF9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHBDD2Q6NTF9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHBDD2Q6NTF9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHBDD2Q6NTF9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHBDD2Q6NTF9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHBDD2Q6NTF9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHBDD2Q6NTF9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHBDD2Q6NTF9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHBDD2Q6NTF9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHBDD2Q6NTF9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHBDD2Q6NTF9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHBDD2Q6NTF9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDD2Q6NTF9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDD2Q6NTF9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDD2Q6NTF9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHBDD2Q6NTF9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHBDD2Q6NTF9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHBDD2Q6NTF9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDD2Q6NTF9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDD2Q6NTF9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDD2Q6NTF9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDD2Q6NTF9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDD2Q6NTF9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDD2Q6NTF9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDD2Q6NTF9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDD2Q6NTF9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHBDD2Q6NTF9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHBDD2Q6NTF9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHBDD2Q6NTF9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHBDD2Q6NTF9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHBDD2Q6NTF9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHBDD2Q6NTF9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHBDD2Q6NTF9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RHBDD2Q6NTF9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHBDD2Q6NTF9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHBDD2Q6NTF9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHBDD2Q6NTF9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHBDD2Q6NTF9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHBDD2Q6NTF9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHBDD2Q6NTF9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHBDD2Q6NTF9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHBDD2Q6NTF9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHBDD2Q6NTF9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RHBDD2Q6NTF9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHBDD2Q6NTF9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHBDD2Q6NTF9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHBDD2Q6NTF9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHBDD2Q6NTF9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHBDD2Q6NTF9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHBDD2Q6NTF9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHBDD2Q6NTF9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHBDD2Q6NTF9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHBDD2Q6NTF9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHBDD2Q6NTF9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHBDD2Q6NTF9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RHBDD2Q6NTF9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RHBDD2Q6NTF9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHBDD2Q6NTF9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHBDD2Q6NTF9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHBDD2Q6NTF9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHBDD2Q6NTF9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHBDD2Q6NTF9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHBDD2Q6NTF9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHBDD2Q6NTF9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RHBDD2Q6NTF9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHBDD2Q6NTF9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHBDD2Q6NTF9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHBDD2Q6NTF9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHBDD2Q6NTF9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHBDD2Q6NTF9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHBDD2Q6NTF9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHBDD2Q6NTF9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RHBDD2Q6NTF9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDD2Q6NTF9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDD2Q6NTF9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDD2Q6NTF9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDD2Q6NTF9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms