Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ89

DENND4C, DENN domain-containing protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND4CQ5VZ89 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DENND4CQ5VZ89 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DENND4CQ5VZ89 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DENND4CQ5VZ89 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DENND4CQ5VZ89 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DENND4CQ5VZ89 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DENND4CQ5VZ89 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DENND4CQ5VZ89 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DENND4CQ5VZ89 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
DENND4CQ5VZ89 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DENND4CQ5VZ89 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DENND4CQ5VZ89 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DENND4CQ5VZ89 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DENND4CQ5VZ89 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DENND4CQ5VZ89 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DENND4CQ5VZ89 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DENND4CQ5VZ89 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DENND4CQ5VZ89 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DENND4CQ5VZ89 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DENND4CQ5VZ89 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DENND4CQ5VZ89 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DENND4CQ5VZ89 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
DENND4CQ5VZ89 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DENND4CQ5VZ89 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DENND4CQ5VZ89 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DENND4CQ5VZ89 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DENND4CQ5VZ89 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DENND4CQ5VZ89 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DENND4CQ5VZ89 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DENND4CQ5VZ89 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DENND4CQ5VZ89 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DENND4CQ5VZ89 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DENND4CQ5VZ89 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DENND4CQ5VZ89 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DENND4CQ5VZ89 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DENND4CQ5VZ89 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DENND4CQ5VZ89 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DENND4CQ5VZ89 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DENND4CQ5VZ89 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DENND4CQ5VZ89 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DENND4CQ5VZ89 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
DENND4CQ5VZ89 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DENND4CQ5VZ89 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DENND4CQ5VZ89 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DENND4CQ5VZ89 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DENND4CQ5VZ89 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DENND4CQ5VZ89 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DENND4CQ5VZ89 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DENND4CQ5VZ89 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
DENND4CQ5VZ89 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
DENND4CQ5VZ89 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DENND4CQ5VZ89 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DENND4CQ5VZ89 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DENND4CQ5VZ89 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DENND4CQ5VZ89 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DENND4CQ5VZ89 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DENND4CQ5VZ89 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DENND4CQ5VZ89 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DENND4CQ5VZ89 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DENND4CQ5VZ89 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
DENND4CQ5VZ89 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
DENND4CQ5VZ89 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DENND4CQ5VZ89 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DENND4CQ5VZ89 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DENND4CQ5VZ89 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DENND4CQ5VZ89 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DENND4CQ5VZ89 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DENND4CQ5VZ89 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DENND4CQ5VZ89 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DENND4CQ5VZ89 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DENND4CQ5VZ89 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DENND4CQ5VZ89 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DENND4CQ5VZ89 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DENND4CQ5VZ89 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
DENND4CQ5VZ89 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DENND4CQ5VZ89 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DENND4CQ5VZ89 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DENND4CQ5VZ89 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DENND4CQ5VZ89 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DENND4CQ5VZ89 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DENND4CQ5VZ89 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DENND4CQ5VZ89 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DENND4CQ5VZ89 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DENND4CQ5VZ89 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DENND4CQ5VZ89 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DENND4CQ5VZ89 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DENND4CQ5VZ89 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DENND4CQ5VZ89 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DENND4CQ5VZ89 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DENND4CQ5VZ89 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DENND4CQ5VZ89 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DENND4CQ5VZ89 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
DENND4CQ5VZ89 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DENND4CQ5VZ89 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DENND4CQ5VZ89 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DENND4CQ5VZ89 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DENND4CQ5VZ89 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DENND4CQ5VZ89 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DENND4CQ5VZ89 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DENND4CQ5VZ89 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms