Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVQ6

YOD1, Ubiquitin thioesterase OTU1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YOD1Q5VVQ6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
YOD1Q5VVQ6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
YOD1Q5VVQ6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
YOD1Q5VVQ6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
YOD1Q5VVQ6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
YOD1Q5VVQ6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
YOD1Q5VVQ6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
YOD1Q5VVQ6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
YOD1Q5VVQ6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
YOD1Q5VVQ6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
YOD1Q5VVQ6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
YOD1Q5VVQ6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
YOD1Q5VVQ6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
YOD1Q5VVQ6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
YOD1Q5VVQ6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
YOD1Q5VVQ6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
YOD1Q5VVQ6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
YOD1Q5VVQ6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
YOD1Q5VVQ6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
YOD1Q5VVQ6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
YOD1Q5VVQ6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
YOD1Q5VVQ6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
YOD1Q5VVQ6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
YOD1Q5VVQ6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
YOD1Q5VVQ6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YOD1Q5VVQ6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YOD1Q5VVQ6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
YOD1Q5VVQ6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YOD1Q5VVQ6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YOD1Q5VVQ6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YOD1Q5VVQ6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YOD1Q5VVQ6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YOD1Q5VVQ6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YOD1Q5VVQ6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YOD1Q5VVQ6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YOD1Q5VVQ6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YOD1Q5VVQ6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YOD1Q5VVQ6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YOD1Q5VVQ6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YOD1Q5VVQ6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YOD1Q5VVQ6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YOD1Q5VVQ6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YOD1Q5VVQ6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YOD1Q5VVQ6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YOD1Q5VVQ6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
YOD1Q5VVQ6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YOD1Q5VVQ6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
YOD1Q5VVQ6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YOD1Q5VVQ6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YOD1Q5VVQ6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YOD1Q5VVQ6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YOD1Q5VVQ6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YOD1Q5VVQ6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YOD1Q5VVQ6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YOD1Q5VVQ6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
YOD1Q5VVQ6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
YOD1Q5VVQ6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
YOD1Q5VVQ6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YOD1Q5VVQ6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
YOD1Q5VVQ6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YOD1Q5VVQ6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
YOD1Q5VVQ6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YOD1Q5VVQ6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YOD1Q5VVQ6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YOD1Q5VVQ6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YOD1Q5VVQ6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
YOD1Q5VVQ6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
YOD1Q5VVQ6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
YOD1Q5VVQ6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YOD1Q5VVQ6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
YOD1Q5VVQ6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
YOD1Q5VVQ6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
YOD1Q5VVQ6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
YOD1Q5VVQ6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
YOD1Q5VVQ6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
YOD1Q5VVQ6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
YOD1Q5VVQ6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
YOD1Q5VVQ6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YOD1Q5VVQ6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
YOD1Q5VVQ6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YOD1Q5VVQ6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YOD1Q5VVQ6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
YOD1Q5VVQ6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
YOD1Q5VVQ6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
YOD1Q5VVQ6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
YOD1Q5VVQ6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
YOD1Q5VVQ6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
YOD1Q5VVQ6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
YOD1Q5VVQ6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
YOD1Q5VVQ6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
YOD1Q5VVQ6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
YOD1Q5VVQ6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
YOD1Q5VVQ6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
YOD1Q5VVQ6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
YOD1Q5VVQ6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
YOD1Q5VVQ6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
YOD1Q5VVQ6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
YOD1Q5VVQ6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
YOD1Q5VVQ6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
YOD1Q5VVQ6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.6 ms