Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT5

MYOM3, Myomesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOM3Q5VTT5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
MYOM3Q5VTT5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
MYOM3Q5VTT5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
MYOM3Q5VTT5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
MYOM3Q5VTT5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
MYOM3Q5VTT5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
MYOM3Q5VTT5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.65
MYOM3Q5VTT5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
MYOM3Q5VTT5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
MYOM3Q5VTT5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
MYOM3Q5VTT5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
MYOM3Q5VTT5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
MYOM3Q5VTT5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
MYOM3Q5VTT5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
MYOM3Q5VTT5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
MYOM3Q5VTT5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
MYOM3Q5VTT5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
MYOM3Q5VTT5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
MYOM3Q5VTT5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
MYOM3Q5VTT5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
MYOM3Q5VTT5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
MYOM3Q5VTT5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
MYOM3Q5VTT5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
MYOM3Q5VTT5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
MYOM3Q5VTT5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
MYOM3Q5VTT5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
MYOM3Q5VTT5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
MYOM3Q5VTT5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
MYOM3Q5VTT5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
MYOM3Q5VTT5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
MYOM3Q5VTT5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
MYOM3Q5VTT5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
MYOM3Q5VTT5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
MYOM3Q5VTT5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
MYOM3Q5VTT5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
MYOM3Q5VTT5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
MYOM3Q5VTT5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
MYOM3Q5VTT5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
MYOM3Q5VTT5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
MYOM3Q5VTT5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
MYOM3Q5VTT5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.62
MYOM3Q5VTT5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.62
MYOM3Q5VTT5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
MYOM3Q5VTT5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
MYOM3Q5VTT5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC37.69■■■■□ 3.62
MYOM3Q5VTT5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
MYOM3Q5VTT5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
MYOM3Q5VTT5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
MYOM3Q5VTT5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
MYOM3Q5VTT5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
MYOM3Q5VTT5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
MYOM3Q5VTT5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
MYOM3Q5VTT5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
MYOM3Q5VTT5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
MYOM3Q5VTT5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC37.67■■■■□ 3.62
MYOM3Q5VTT5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
MYOM3Q5VTT5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
MYOM3Q5VTT5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC37.65■■■■□ 3.62
MYOM3Q5VTT5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
MYOM3Q5VTT5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
MYOM3Q5VTT5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
MYOM3Q5VTT5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
MYOM3Q5VTT5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
MYOM3Q5VTT5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
MYOM3Q5VTT5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
MYOM3Q5VTT5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
MYOM3Q5VTT5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
MYOM3Q5VTT5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
MYOM3Q5VTT5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
MYOM3Q5VTT5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
MYOM3Q5VTT5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
MYOM3Q5VTT5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
MYOM3Q5VTT5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
MYOM3Q5VTT5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
MYOM3Q5VTT5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
MYOM3Q5VTT5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
MYOM3Q5VTT5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
MYOM3Q5VTT5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
MYOM3Q5VTT5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
MYOM3Q5VTT5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
MYOM3Q5VTT5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
MYOM3Q5VTT5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
MYOM3Q5VTT5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
MYOM3Q5VTT5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
MYOM3Q5VTT5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
MYOM3Q5VTT5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
MYOM3Q5VTT5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
MYOM3Q5VTT5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
MYOM3Q5VTT5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
MYOM3Q5VTT5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
MYOM3Q5VTT5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
MYOM3Q5VTT5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
MYOM3Q5VTT5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
MYOM3Q5VTT5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
MYOM3Q5VTT5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
MYOM3Q5VTT5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
MYOM3Q5VTT5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC37.53■■■■□ 3.6
MYOM3Q5VTT5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
MYOM3Q5VTT5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
MYOM3Q5VTT5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms