Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF220Q5VTB9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF220Q5VTB9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF220Q5VTB9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF220Q5VTB9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF220Q5VTB9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF220Q5VTB9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF220Q5VTB9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF220Q5VTB9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF220Q5VTB9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF220Q5VTB9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF220Q5VTB9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF220Q5VTB9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF220Q5VTB9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF220Q5VTB9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF220Q5VTB9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF220Q5VTB9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF220Q5VTB9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF220Q5VTB9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF220Q5VTB9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF220Q5VTB9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF220Q5VTB9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF220Q5VTB9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF220Q5VTB9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF220Q5VTB9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF220Q5VTB9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF220Q5VTB9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF220Q5VTB9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF220Q5VTB9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF220Q5VTB9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF220Q5VTB9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF220Q5VTB9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF220Q5VTB9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF220Q5VTB9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF220Q5VTB9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF220Q5VTB9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF220Q5VTB9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF220Q5VTB9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF220Q5VTB9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF220Q5VTB9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF220Q5VTB9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF220Q5VTB9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF220Q5VTB9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF220Q5VTB9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF220Q5VTB9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF220Q5VTB9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF220Q5VTB9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF220Q5VTB9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF220Q5VTB9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF220Q5VTB9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF220Q5VTB9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF220Q5VTB9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF220Q5VTB9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF220Q5VTB9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF220Q5VTB9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF220Q5VTB9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF220Q5VTB9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF220Q5VTB9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF220Q5VTB9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF220Q5VTB9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF220Q5VTB9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF220Q5VTB9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF220Q5VTB9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF220Q5VTB9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF220Q5VTB9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF220Q5VTB9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF220Q5VTB9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF220Q5VTB9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF220Q5VTB9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF220Q5VTB9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF220Q5VTB9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF220Q5VTB9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF220Q5VTB9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF220Q5VTB9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF220Q5VTB9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF220Q5VTB9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF220Q5VTB9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF220Q5VTB9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF220Q5VTB9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF220Q5VTB9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF220Q5VTB9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF220Q5VTB9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF220Q5VTB9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF220Q5VTB9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF220Q5VTB9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF220Q5VTB9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF220Q5VTB9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF220Q5VTB9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF220Q5VTB9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF220Q5VTB9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF220Q5VTB9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF220Q5VTB9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF220Q5VTB9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF220Q5VTB9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF220Q5VTB9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF220Q5VTB9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF220Q5VTB9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF220Q5VTB9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF220Q5VTB9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF220Q5VTB9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms