Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LDLRAP1Q5SW96 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LDLRAP1Q5SW96 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LDLRAP1Q5SW96 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LDLRAP1Q5SW96 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LDLRAP1Q5SW96 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LDLRAP1Q5SW96 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LDLRAP1Q5SW96 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LDLRAP1Q5SW96 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LDLRAP1Q5SW96 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LDLRAP1Q5SW96 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LDLRAP1Q5SW96 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LDLRAP1Q5SW96 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LDLRAP1Q5SW96 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LDLRAP1Q5SW96 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LDLRAP1Q5SW96 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LDLRAP1Q5SW96 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LDLRAP1Q5SW96 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LDLRAP1Q5SW96 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LDLRAP1Q5SW96 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LDLRAP1Q5SW96 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LDLRAP1Q5SW96 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LDLRAP1Q5SW96 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LDLRAP1Q5SW96 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LDLRAP1Q5SW96 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LDLRAP1Q5SW96 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LDLRAP1Q5SW96 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LDLRAP1Q5SW96 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LDLRAP1Q5SW96 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LDLRAP1Q5SW96 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LDLRAP1Q5SW96 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LDLRAP1Q5SW96 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LDLRAP1Q5SW96 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LDLRAP1Q5SW96 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LDLRAP1Q5SW96 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LDLRAP1Q5SW96 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LDLRAP1Q5SW96 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LDLRAP1Q5SW96 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LDLRAP1Q5SW96 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LDLRAP1Q5SW96 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LDLRAP1Q5SW96 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LDLRAP1Q5SW96 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LDLRAP1Q5SW96 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LDLRAP1Q5SW96 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LDLRAP1Q5SW96 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LDLRAP1Q5SW96 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LDLRAP1Q5SW96 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LDLRAP1Q5SW96 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LDLRAP1Q5SW96 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LDLRAP1Q5SW96 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LDLRAP1Q5SW96 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LDLRAP1Q5SW96 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LDLRAP1Q5SW96 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LDLRAP1Q5SW96 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDLRAP1Q5SW96 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDLRAP1Q5SW96 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDLRAP1Q5SW96 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDLRAP1Q5SW96 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDLRAP1Q5SW96 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDLRAP1Q5SW96 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDLRAP1Q5SW96 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDLRAP1Q5SW96 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDLRAP1Q5SW96 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDLRAP1Q5SW96 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LDLRAP1Q5SW96 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LDLRAP1Q5SW96 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LDLRAP1Q5SW96 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LDLRAP1Q5SW96 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LDLRAP1Q5SW96 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LDLRAP1Q5SW96 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LDLRAP1Q5SW96 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LDLRAP1Q5SW96 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LDLRAP1Q5SW96 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LDLRAP1Q5SW96 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LDLRAP1Q5SW96 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LDLRAP1Q5SW96 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LDLRAP1Q5SW96 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LDLRAP1Q5SW96 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDLRAP1Q5SW96 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDLRAP1Q5SW96 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDLRAP1Q5SW96 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDLRAP1Q5SW96 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDLRAP1Q5SW96 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDLRAP1Q5SW96 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDLRAP1Q5SW96 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LDLRAP1Q5SW96 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LDLRAP1Q5SW96 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LDLRAP1Q5SW96 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LDLRAP1Q5SW96 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LDLRAP1Q5SW96 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LDLRAP1Q5SW96 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LDLRAP1Q5SW96 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LDLRAP1Q5SW96 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LDLRAP1Q5SW96 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LDLRAP1Q5SW96 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LDLRAP1Q5SW96 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LDLRAP1Q5SW96 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LDLRAP1Q5SW96 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LDLRAP1Q5SW96 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LDLRAP1Q5SW96 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms