Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV17

TMEM240, Transmembrane protein 240, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM240Q5SV17 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM240Q5SV17 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM240Q5SV17 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TMEM240Q5SV17 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM240Q5SV17 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM240Q5SV17 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM240Q5SV17 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM240Q5SV17 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM240Q5SV17 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM240Q5SV17 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM240Q5SV17 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM240Q5SV17 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM240Q5SV17 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM240Q5SV17 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM240Q5SV17 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM240Q5SV17 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM240Q5SV17 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM240Q5SV17 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM240Q5SV17 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM240Q5SV17 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM240Q5SV17 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM240Q5SV17 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM240Q5SV17 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TMEM240Q5SV17 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMEM240Q5SV17 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMEM240Q5SV17 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMEM240Q5SV17 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMEM240Q5SV17 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM240Q5SV17 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM240Q5SV17 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM240Q5SV17 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM240Q5SV17 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM240Q5SV17 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM240Q5SV17 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM240Q5SV17 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM240Q5SV17 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM240Q5SV17 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM240Q5SV17 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM240Q5SV17 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM240Q5SV17 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM240Q5SV17 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM240Q5SV17 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM240Q5SV17 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM240Q5SV17 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM240Q5SV17 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM240Q5SV17 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM240Q5SV17 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM240Q5SV17 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM240Q5SV17 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM240Q5SV17 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM240Q5SV17 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMEM240Q5SV17 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM240Q5SV17 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM240Q5SV17 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM240Q5SV17 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM240Q5SV17 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM240Q5SV17 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM240Q5SV17 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM240Q5SV17 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM240Q5SV17 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM240Q5SV17 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM240Q5SV17 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM240Q5SV17 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM240Q5SV17 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM240Q5SV17 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM240Q5SV17 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM240Q5SV17 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM240Q5SV17 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM240Q5SV17 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM240Q5SV17 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM240Q5SV17 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM240Q5SV17 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM240Q5SV17 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM240Q5SV17 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM240Q5SV17 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM240Q5SV17 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM240Q5SV17 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM240Q5SV17 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM240Q5SV17 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM240Q5SV17 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM240Q5SV17 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM240Q5SV17 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM240Q5SV17 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM240Q5SV17 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM240Q5SV17 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM240Q5SV17 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM240Q5SV17 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM240Q5SV17 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM240Q5SV17 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM240Q5SV17 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM240Q5SV17 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM240Q5SV17 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM240Q5SV17 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM240Q5SV17 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM240Q5SV17 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM240Q5SV17 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM240Q5SV17 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM240Q5SV17 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM240Q5SV17 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM240Q5SV17 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms