Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SDK2Q58EX2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SDK2Q58EX2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SDK2Q58EX2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDK2Q58EX2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDK2Q58EX2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDK2Q58EX2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDK2Q58EX2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDK2Q58EX2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDK2Q58EX2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SDK2Q58EX2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDK2Q58EX2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SDK2Q58EX2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDK2Q58EX2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDK2Q58EX2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SDK2Q58EX2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDK2Q58EX2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDK2Q58EX2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDK2Q58EX2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDK2Q58EX2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDK2Q58EX2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDK2Q58EX2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDK2Q58EX2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDK2Q58EX2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDK2Q58EX2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDK2Q58EX2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDK2Q58EX2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDK2Q58EX2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDK2Q58EX2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDK2Q58EX2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDK2Q58EX2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDK2Q58EX2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDK2Q58EX2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDK2Q58EX2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDK2Q58EX2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDK2Q58EX2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDK2Q58EX2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDK2Q58EX2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDK2Q58EX2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SDK2Q58EX2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDK2Q58EX2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDK2Q58EX2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDK2Q58EX2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDK2Q58EX2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDK2Q58EX2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDK2Q58EX2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDK2Q58EX2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDK2Q58EX2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDK2Q58EX2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDK2Q58EX2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDK2Q58EX2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SDK2Q58EX2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDK2Q58EX2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDK2Q58EX2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDK2Q58EX2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDK2Q58EX2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDK2Q58EX2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDK2Q58EX2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDK2Q58EX2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDK2Q58EX2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDK2Q58EX2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDK2Q58EX2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDK2Q58EX2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDK2Q58EX2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDK2Q58EX2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDK2Q58EX2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDK2Q58EX2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDK2Q58EX2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SDK2Q58EX2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDK2Q58EX2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDK2Q58EX2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDK2Q58EX2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDK2Q58EX2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDK2Q58EX2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDK2Q58EX2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDK2Q58EX2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDK2Q58EX2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SDK2Q58EX2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDK2Q58EX2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDK2Q58EX2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDK2Q58EX2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SDK2Q58EX2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDK2Q58EX2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDK2Q58EX2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDK2Q58EX2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDK2Q58EX2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDK2Q58EX2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDK2Q58EX2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDK2Q58EX2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDK2Q58EX2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDK2Q58EX2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDK2Q58EX2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDK2Q58EX2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDK2Q58EX2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDK2Q58EX2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDK2Q58EX2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDK2Q58EX2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDK2Q58EX2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDK2Q58EX2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDK2Q58EX2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms