Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB6CQ53S08 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB6CQ53S08 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB6CQ53S08 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB6CQ53S08 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB6CQ53S08 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB6CQ53S08 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB6CQ53S08 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB6CQ53S08 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB6CQ53S08 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB6CQ53S08 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB6CQ53S08 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB6CQ53S08 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB6CQ53S08 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB6CQ53S08 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB6CQ53S08 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB6CQ53S08 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB6CQ53S08 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB6CQ53S08 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB6CQ53S08 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB6CQ53S08 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB6CQ53S08 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB6CQ53S08 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB6CQ53S08 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB6CQ53S08 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB6CQ53S08 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB6CQ53S08 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB6CQ53S08 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB6CQ53S08 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB6CQ53S08 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB6CQ53S08 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB6CQ53S08 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB6CQ53S08 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB6CQ53S08 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB6CQ53S08 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB6CQ53S08 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RAB6CQ53S08 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB6CQ53S08 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB6CQ53S08 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB6CQ53S08 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB6CQ53S08 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB6CQ53S08 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB6CQ53S08 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB6CQ53S08 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB6CQ53S08 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB6CQ53S08 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB6CQ53S08 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB6CQ53S08 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB6CQ53S08 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB6CQ53S08 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB6CQ53S08 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB6CQ53S08 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB6CQ53S08 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB6CQ53S08 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB6CQ53S08 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB6CQ53S08 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB6CQ53S08 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB6CQ53S08 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB6CQ53S08 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB6CQ53S08 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB6CQ53S08 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB6CQ53S08 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB6CQ53S08 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB6CQ53S08 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB6CQ53S08 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB6CQ53S08 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB6CQ53S08 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB6CQ53S08 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB6CQ53S08 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB6CQ53S08 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB6CQ53S08 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB6CQ53S08 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB6CQ53S08 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB6CQ53S08 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB6CQ53S08 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB6CQ53S08 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB6CQ53S08 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB6CQ53S08 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB6CQ53S08 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB6CQ53S08 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB6CQ53S08 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB6CQ53S08 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB6CQ53S08 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB6CQ53S08 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB6CQ53S08 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB6CQ53S08 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB6CQ53S08 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB6CQ53S08 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB6CQ53S08 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB6CQ53S08 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB6CQ53S08 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB6CQ53S08 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB6CQ53S08 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB6CQ53S08 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB6CQ53S08 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB6CQ53S08 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB6CQ53S08 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB6CQ53S08 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB6CQ53S08 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB6CQ53S08 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms