Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC92Q53HC0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC92Q53HC0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC92Q53HC0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC92Q53HC0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC92Q53HC0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC92Q53HC0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC92Q53HC0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC92Q53HC0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC92Q53HC0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC92Q53HC0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC92Q53HC0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC92Q53HC0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC92Q53HC0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC92Q53HC0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC92Q53HC0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC92Q53HC0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC92Q53HC0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC92Q53HC0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC92Q53HC0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC92Q53HC0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC92Q53HC0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC92Q53HC0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC92Q53HC0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC92Q53HC0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC92Q53HC0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC92Q53HC0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC92Q53HC0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC92Q53HC0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC92Q53HC0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC92Q53HC0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC92Q53HC0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC92Q53HC0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC92Q53HC0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC92Q53HC0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC92Q53HC0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC92Q53HC0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC92Q53HC0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC92Q53HC0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC92Q53HC0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC92Q53HC0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC92Q53HC0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC92Q53HC0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC92Q53HC0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC92Q53HC0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC92Q53HC0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC92Q53HC0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC92Q53HC0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC92Q53HC0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC92Q53HC0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC92Q53HC0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC92Q53HC0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC92Q53HC0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC92Q53HC0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC92Q53HC0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC92Q53HC0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC92Q53HC0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC92Q53HC0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC92Q53HC0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC92Q53HC0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC92Q53HC0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC92Q53HC0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC92Q53HC0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC92Q53HC0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC92Q53HC0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC92Q53HC0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC92Q53HC0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC92Q53HC0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC92Q53HC0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC92Q53HC0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC92Q53HC0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC92Q53HC0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC92Q53HC0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC92Q53HC0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC92Q53HC0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC92Q53HC0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC92Q53HC0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC92Q53HC0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC92Q53HC0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC92Q53HC0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC92Q53HC0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC92Q53HC0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC92Q53HC0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC92Q53HC0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC92Q53HC0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC92Q53HC0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC92Q53HC0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC92Q53HC0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC92Q53HC0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC92Q53HC0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC92Q53HC0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC92Q53HC0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC92Q53HC0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC92Q53HC0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC92Q53HC0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC92Q53HC0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC92Q53HC0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC92Q53HC0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC92Q53HC0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC92Q53HC0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms