Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC1

ATP13A4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A4Q4VNC1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP13A4Q4VNC1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP13A4Q4VNC1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP13A4Q4VNC1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP13A4Q4VNC1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP13A4Q4VNC1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP13A4Q4VNC1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP13A4Q4VNC1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP13A4Q4VNC1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP13A4Q4VNC1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP13A4Q4VNC1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP13A4Q4VNC1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP13A4Q4VNC1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP13A4Q4VNC1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP13A4Q4VNC1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP13A4Q4VNC1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP13A4Q4VNC1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP13A4Q4VNC1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP13A4Q4VNC1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP13A4Q4VNC1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP13A4Q4VNC1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP13A4Q4VNC1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP13A4Q4VNC1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP13A4Q4VNC1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP13A4Q4VNC1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP13A4Q4VNC1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP13A4Q4VNC1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP13A4Q4VNC1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP13A4Q4VNC1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP13A4Q4VNC1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP13A4Q4VNC1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP13A4Q4VNC1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP13A4Q4VNC1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP13A4Q4VNC1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP13A4Q4VNC1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP13A4Q4VNC1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP13A4Q4VNC1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP13A4Q4VNC1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP13A4Q4VNC1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP13A4Q4VNC1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP13A4Q4VNC1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP13A4Q4VNC1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP13A4Q4VNC1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP13A4Q4VNC1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP13A4Q4VNC1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP13A4Q4VNC1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP13A4Q4VNC1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP13A4Q4VNC1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP13A4Q4VNC1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP13A4Q4VNC1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP13A4Q4VNC1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP13A4Q4VNC1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP13A4Q4VNC1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP13A4Q4VNC1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP13A4Q4VNC1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP13A4Q4VNC1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP13A4Q4VNC1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP13A4Q4VNC1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP13A4Q4VNC1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP13A4Q4VNC1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP13A4Q4VNC1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP13A4Q4VNC1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP13A4Q4VNC1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP13A4Q4VNC1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP13A4Q4VNC1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP13A4Q4VNC1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP13A4Q4VNC1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP13A4Q4VNC1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP13A4Q4VNC1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP13A4Q4VNC1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP13A4Q4VNC1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP13A4Q4VNC1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP13A4Q4VNC1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP13A4Q4VNC1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP13A4Q4VNC1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP13A4Q4VNC1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP13A4Q4VNC1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP13A4Q4VNC1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP13A4Q4VNC1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP13A4Q4VNC1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP13A4Q4VNC1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP13A4Q4VNC1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP13A4Q4VNC1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP13A4Q4VNC1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP13A4Q4VNC1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP13A4Q4VNC1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP13A4Q4VNC1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP13A4Q4VNC1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP13A4Q4VNC1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP13A4Q4VNC1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP13A4Q4VNC1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP13A4Q4VNC1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP13A4Q4VNC1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP13A4Q4VNC1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP13A4Q4VNC1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP13A4Q4VNC1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP13A4Q4VNC1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP13A4Q4VNC1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATP13A4Q4VNC1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP13A4Q4VNC1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms