Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBRG1Q3YBR2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBRG1Q3YBR2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBRG1Q3YBR2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBRG1Q3YBR2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBRG1Q3YBR2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBRG1Q3YBR2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBRG1Q3YBR2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBRG1Q3YBR2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBRG1Q3YBR2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBRG1Q3YBR2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBRG1Q3YBR2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TBRG1Q3YBR2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TBRG1Q3YBR2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TBRG1Q3YBR2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TBRG1Q3YBR2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TBRG1Q3YBR2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TBRG1Q3YBR2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TBRG1Q3YBR2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TBRG1Q3YBR2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TBRG1Q3YBR2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TBRG1Q3YBR2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TBRG1Q3YBR2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TBRG1Q3YBR2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TBRG1Q3YBR2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TBRG1Q3YBR2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TBRG1Q3YBR2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TBRG1Q3YBR2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TBRG1Q3YBR2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TBRG1Q3YBR2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TBRG1Q3YBR2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TBRG1Q3YBR2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TBRG1Q3YBR2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TBRG1Q3YBR2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TBRG1Q3YBR2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TBRG1Q3YBR2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TBRG1Q3YBR2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBRG1Q3YBR2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBRG1Q3YBR2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBRG1Q3YBR2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBRG1Q3YBR2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBRG1Q3YBR2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBRG1Q3YBR2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBRG1Q3YBR2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBRG1Q3YBR2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBRG1Q3YBR2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBRG1Q3YBR2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBRG1Q3YBR2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBRG1Q3YBR2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBRG1Q3YBR2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBRG1Q3YBR2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBRG1Q3YBR2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBRG1Q3YBR2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBRG1Q3YBR2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBRG1Q3YBR2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBRG1Q3YBR2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBRG1Q3YBR2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBRG1Q3YBR2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBRG1Q3YBR2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TBRG1Q3YBR2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TBRG1Q3YBR2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TBRG1Q3YBR2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TBRG1Q3YBR2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TBRG1Q3YBR2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TBRG1Q3YBR2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBRG1Q3YBR2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBRG1Q3YBR2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBRG1Q3YBR2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBRG1Q3YBR2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBRG1Q3YBR2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBRG1Q3YBR2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBRG1Q3YBR2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBRG1Q3YBR2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TBRG1Q3YBR2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TBRG1Q3YBR2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TBRG1Q3YBR2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TBRG1Q3YBR2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TBRG1Q3YBR2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBRG1Q3YBR2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBRG1Q3YBR2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBRG1Q3YBR2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TBRG1Q3YBR2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBRG1Q3YBR2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TBRG1Q3YBR2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TBRG1Q3YBR2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TBRG1Q3YBR2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TBRG1Q3YBR2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TBRG1Q3YBR2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TBRG1Q3YBR2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TBRG1Q3YBR2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TBRG1Q3YBR2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBRG1Q3YBR2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBRG1Q3YBR2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBRG1Q3YBR2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBRG1Q3YBR2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBRG1Q3YBR2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBRG1Q3YBR2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBRG1Q3YBR2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBRG1Q3YBR2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBRG1Q3YBR2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms