Protein–RNA interactions for Protein: Q3LXA3

TKFC, Triokinase/FMN cyclase, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TKFCQ3LXA3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TKFCQ3LXA3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TKFCQ3LXA3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TKFCQ3LXA3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TKFCQ3LXA3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TKFCQ3LXA3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TKFCQ3LXA3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TKFCQ3LXA3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TKFCQ3LXA3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TKFCQ3LXA3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TKFCQ3LXA3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TKFCQ3LXA3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TKFCQ3LXA3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TKFCQ3LXA3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TKFCQ3LXA3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TKFCQ3LXA3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TKFCQ3LXA3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TKFCQ3LXA3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TKFCQ3LXA3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TKFCQ3LXA3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TKFCQ3LXA3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TKFCQ3LXA3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TKFCQ3LXA3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TKFCQ3LXA3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TKFCQ3LXA3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TKFCQ3LXA3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TKFCQ3LXA3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TKFCQ3LXA3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TKFCQ3LXA3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TKFCQ3LXA3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TKFCQ3LXA3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TKFCQ3LXA3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TKFCQ3LXA3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TKFCQ3LXA3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TKFCQ3LXA3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TKFCQ3LXA3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TKFCQ3LXA3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TKFCQ3LXA3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TKFCQ3LXA3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TKFCQ3LXA3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TKFCQ3LXA3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TKFCQ3LXA3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TKFCQ3LXA3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TKFCQ3LXA3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TKFCQ3LXA3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TKFCQ3LXA3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TKFCQ3LXA3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TKFCQ3LXA3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TKFCQ3LXA3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TKFCQ3LXA3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TKFCQ3LXA3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TKFCQ3LXA3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TKFCQ3LXA3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TKFCQ3LXA3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TKFCQ3LXA3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TKFCQ3LXA3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TKFCQ3LXA3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TKFCQ3LXA3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TKFCQ3LXA3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TKFCQ3LXA3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TKFCQ3LXA3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TKFCQ3LXA3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TKFCQ3LXA3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TKFCQ3LXA3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TKFCQ3LXA3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TKFCQ3LXA3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TKFCQ3LXA3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TKFCQ3LXA3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TKFCQ3LXA3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TKFCQ3LXA3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TKFCQ3LXA3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TKFCQ3LXA3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TKFCQ3LXA3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TKFCQ3LXA3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TKFCQ3LXA3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TKFCQ3LXA3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TKFCQ3LXA3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TKFCQ3LXA3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TKFCQ3LXA3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TKFCQ3LXA3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TKFCQ3LXA3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TKFCQ3LXA3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TKFCQ3LXA3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TKFCQ3LXA3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TKFCQ3LXA3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TKFCQ3LXA3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TKFCQ3LXA3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TKFCQ3LXA3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TKFCQ3LXA3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TKFCQ3LXA3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TKFCQ3LXA3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TKFCQ3LXA3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TKFCQ3LXA3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TKFCQ3LXA3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TKFCQ3LXA3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TKFCQ3LXA3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TKFCQ3LXA3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TKFCQ3LXA3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TKFCQ3LXA3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TKFCQ3LXA3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms