Protein–RNA interactions for Protein: Q30KR1

DEFB109B, Putative beta-defensin 109B, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFB109BQ30KR1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DEFB109BQ30KR1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DEFB109BQ30KR1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DEFB109BQ30KR1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DEFB109BQ30KR1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DEFB109BQ30KR1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DEFB109BQ30KR1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DEFB109BQ30KR1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DEFB109BQ30KR1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DEFB109BQ30KR1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DEFB109BQ30KR1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DEFB109BQ30KR1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DEFB109BQ30KR1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DEFB109BQ30KR1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DEFB109BQ30KR1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DEFB109BQ30KR1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DEFB109BQ30KR1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DEFB109BQ30KR1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DEFB109BQ30KR1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DEFB109BQ30KR1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DEFB109BQ30KR1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DEFB109BQ30KR1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DEFB109BQ30KR1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DEFB109BQ30KR1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DEFB109BQ30KR1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DEFB109BQ30KR1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DEFB109BQ30KR1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DEFB109BQ30KR1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DEFB109BQ30KR1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DEFB109BQ30KR1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DEFB109BQ30KR1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DEFB109BQ30KR1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DEFB109BQ30KR1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DEFB109BQ30KR1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DEFB109BQ30KR1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DEFB109BQ30KR1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DEFB109BQ30KR1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DEFB109BQ30KR1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DEFB109BQ30KR1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DEFB109BQ30KR1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DEFB109BQ30KR1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DEFB109BQ30KR1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DEFB109BQ30KR1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DEFB109BQ30KR1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DEFB109BQ30KR1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DEFB109BQ30KR1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DEFB109BQ30KR1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEFB109BQ30KR1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEFB109BQ30KR1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEFB109BQ30KR1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEFB109BQ30KR1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DEFB109BQ30KR1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DEFB109BQ30KR1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DEFB109BQ30KR1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DEFB109BQ30KR1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DEFB109BQ30KR1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DEFB109BQ30KR1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DEFB109BQ30KR1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEFB109BQ30KR1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEFB109BQ30KR1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEFB109BQ30KR1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEFB109BQ30KR1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEFB109BQ30KR1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEFB109BQ30KR1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEFB109BQ30KR1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DEFB109BQ30KR1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DEFB109BQ30KR1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DEFB109BQ30KR1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DEFB109BQ30KR1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DEFB109BQ30KR1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DEFB109BQ30KR1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
DEFB109BQ30KR1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DEFB109BQ30KR1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEFB109BQ30KR1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEFB109BQ30KR1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEFB109BQ30KR1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEFB109BQ30KR1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEFB109BQ30KR1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEFB109BQ30KR1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEFB109BQ30KR1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEFB109BQ30KR1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEFB109BQ30KR1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEFB109BQ30KR1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DEFB109BQ30KR1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEFB109BQ30KR1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEFB109BQ30KR1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEFB109BQ30KR1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEFB109BQ30KR1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEFB109BQ30KR1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEFB109BQ30KR1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEFB109BQ30KR1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEFB109BQ30KR1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEFB109BQ30KR1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEFB109BQ30KR1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEFB109BQ30KR1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEFB109BQ30KR1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEFB109BQ30KR1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEFB109BQ30KR1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEFB109BQ30KR1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEFB109BQ30KR1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms