Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UVSSAQ2YD98 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UVSSAQ2YD98 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UVSSAQ2YD98 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UVSSAQ2YD98 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
UVSSAQ2YD98 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UVSSAQ2YD98 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UVSSAQ2YD98 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UVSSAQ2YD98 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UVSSAQ2YD98 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UVSSAQ2YD98 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UVSSAQ2YD98 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UVSSAQ2YD98 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UVSSAQ2YD98 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
UVSSAQ2YD98 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
UVSSAQ2YD98 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UVSSAQ2YD98 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
UVSSAQ2YD98 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
UVSSAQ2YD98 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UVSSAQ2YD98 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
UVSSAQ2YD98 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
UVSSAQ2YD98 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
UVSSAQ2YD98 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
UVSSAQ2YD98 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
UVSSAQ2YD98 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
UVSSAQ2YD98 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UVSSAQ2YD98 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UVSSAQ2YD98 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UVSSAQ2YD98 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UVSSAQ2YD98 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UVSSAQ2YD98 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UVSSAQ2YD98 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UVSSAQ2YD98 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
UVSSAQ2YD98 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UVSSAQ2YD98 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UVSSAQ2YD98 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UVSSAQ2YD98 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
UVSSAQ2YD98 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
UVSSAQ2YD98 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UVSSAQ2YD98 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
UVSSAQ2YD98 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UVSSAQ2YD98 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
UVSSAQ2YD98 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
UVSSAQ2YD98 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
UVSSAQ2YD98 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
UVSSAQ2YD98 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
UVSSAQ2YD98 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
UVSSAQ2YD98 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
UVSSAQ2YD98 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
UVSSAQ2YD98 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
UVSSAQ2YD98 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
UVSSAQ2YD98 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
UVSSAQ2YD98 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
UVSSAQ2YD98 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
UVSSAQ2YD98 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
UVSSAQ2YD98 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
UVSSAQ2YD98 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
UVSSAQ2YD98 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UVSSAQ2YD98 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UVSSAQ2YD98 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
UVSSAQ2YD98 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UVSSAQ2YD98 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
UVSSAQ2YD98 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
UVSSAQ2YD98 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
UVSSAQ2YD98 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
UVSSAQ2YD98 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
UVSSAQ2YD98 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
UVSSAQ2YD98 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
UVSSAQ2YD98 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
UVSSAQ2YD98 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
UVSSAQ2YD98 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
UVSSAQ2YD98 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
UVSSAQ2YD98 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
UVSSAQ2YD98 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
UVSSAQ2YD98 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
UVSSAQ2YD98 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
UVSSAQ2YD98 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
UVSSAQ2YD98 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UVSSAQ2YD98 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UVSSAQ2YD98 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
UVSSAQ2YD98 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UVSSAQ2YD98 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
UVSSAQ2YD98 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
UVSSAQ2YD98 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UVSSAQ2YD98 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
UVSSAQ2YD98 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
UVSSAQ2YD98 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UVSSAQ2YD98 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
UVSSAQ2YD98 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UVSSAQ2YD98 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UVSSAQ2YD98 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UVSSAQ2YD98 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UVSSAQ2YD98 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UVSSAQ2YD98 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UVSSAQ2YD98 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UVSSAQ2YD98 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UVSSAQ2YD98 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UVSSAQ2YD98 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
UVSSAQ2YD98 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UVSSAQ2YD98 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.4 ms