Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TYSND1Q2T9J0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TYSND1Q2T9J0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TYSND1Q2T9J0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TYSND1Q2T9J0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TYSND1Q2T9J0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TYSND1Q2T9J0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TYSND1Q2T9J0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TYSND1Q2T9J0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TYSND1Q2T9J0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TYSND1Q2T9J0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TYSND1Q2T9J0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TYSND1Q2T9J0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TYSND1Q2T9J0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TYSND1Q2T9J0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TYSND1Q2T9J0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TYSND1Q2T9J0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TYSND1Q2T9J0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TYSND1Q2T9J0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TYSND1Q2T9J0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TYSND1Q2T9J0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TYSND1Q2T9J0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms