Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM71Q2Q1W2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM71Q2Q1W2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM71Q2Q1W2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM71Q2Q1W2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM71Q2Q1W2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM71Q2Q1W2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM71Q2Q1W2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM71Q2Q1W2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM71Q2Q1W2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM71Q2Q1W2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM71Q2Q1W2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM71Q2Q1W2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM71Q2Q1W2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM71Q2Q1W2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM71Q2Q1W2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM71Q2Q1W2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRIM71Q2Q1W2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM71Q2Q1W2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM71Q2Q1W2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM71Q2Q1W2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM71Q2Q1W2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM71Q2Q1W2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM71Q2Q1W2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM71Q2Q1W2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM71Q2Q1W2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM71Q2Q1W2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM71Q2Q1W2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM71Q2Q1W2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM71Q2Q1W2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM71Q2Q1W2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM71Q2Q1W2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM71Q2Q1W2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM71Q2Q1W2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM71Q2Q1W2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM71Q2Q1W2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM71Q2Q1W2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM71Q2Q1W2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM71Q2Q1W2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM71Q2Q1W2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM71Q2Q1W2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM71Q2Q1W2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM71Q2Q1W2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM71Q2Q1W2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM71Q2Q1W2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM71Q2Q1W2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM71Q2Q1W2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM71Q2Q1W2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
TRIM71Q2Q1W2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM71Q2Q1W2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM71Q2Q1W2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM71Q2Q1W2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM71Q2Q1W2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM71Q2Q1W2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM71Q2Q1W2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM71Q2Q1W2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM71Q2Q1W2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM71Q2Q1W2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM71Q2Q1W2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM71Q2Q1W2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM71Q2Q1W2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM71Q2Q1W2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM71Q2Q1W2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM71Q2Q1W2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM71Q2Q1W2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM71Q2Q1W2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM71Q2Q1W2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM71Q2Q1W2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM71Q2Q1W2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM71Q2Q1W2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM71Q2Q1W2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM71Q2Q1W2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM71Q2Q1W2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM71Q2Q1W2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM71Q2Q1W2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM71Q2Q1W2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM71Q2Q1W2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM71Q2Q1W2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM71Q2Q1W2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM71Q2Q1W2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM71Q2Q1W2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM71Q2Q1W2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM71Q2Q1W2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM71Q2Q1W2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM71Q2Q1W2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM71Q2Q1W2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM71Q2Q1W2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM71Q2Q1W2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM71Q2Q1W2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM71Q2Q1W2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM71Q2Q1W2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM71Q2Q1W2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM71Q2Q1W2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM71Q2Q1W2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM71Q2Q1W2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM71Q2Q1W2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM71Q2Q1W2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM71Q2Q1W2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM71Q2Q1W2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM71Q2Q1W2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms