Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IMPG1Q17R60 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IMPG1Q17R60 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IMPG1Q17R60 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IMPG1Q17R60 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IMPG1Q17R60 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IMPG1Q17R60 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IMPG1Q17R60 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IMPG1Q17R60 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IMPG1Q17R60 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IMPG1Q17R60 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IMPG1Q17R60 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IMPG1Q17R60 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IMPG1Q17R60 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IMPG1Q17R60 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IMPG1Q17R60 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IMPG1Q17R60 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IMPG1Q17R60 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
IMPG1Q17R60 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IMPG1Q17R60 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IMPG1Q17R60 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IMPG1Q17R60 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IMPG1Q17R60 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IMPG1Q17R60 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IMPG1Q17R60 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IMPG1Q17R60 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IMPG1Q17R60 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IMPG1Q17R60 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
IMPG1Q17R60 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IMPG1Q17R60 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IMPG1Q17R60 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IMPG1Q17R60 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IMPG1Q17R60 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IMPG1Q17R60 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IMPG1Q17R60 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IMPG1Q17R60 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IMPG1Q17R60 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IMPG1Q17R60 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IMPG1Q17R60 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IMPG1Q17R60 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IMPG1Q17R60 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IMPG1Q17R60 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IMPG1Q17R60 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IMPG1Q17R60 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IMPG1Q17R60 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IMPG1Q17R60 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IMPG1Q17R60 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IMPG1Q17R60 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
IMPG1Q17R60 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IMPG1Q17R60 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IMPG1Q17R60 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IMPG1Q17R60 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IMPG1Q17R60 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IMPG1Q17R60 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IMPG1Q17R60 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IMPG1Q17R60 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IMPG1Q17R60 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IMPG1Q17R60 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IMPG1Q17R60 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IMPG1Q17R60 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IMPG1Q17R60 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IMPG1Q17R60 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IMPG1Q17R60 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IMPG1Q17R60 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IMPG1Q17R60 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IMPG1Q17R60 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IMPG1Q17R60 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IMPG1Q17R60 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IMPG1Q17R60 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IMPG1Q17R60 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IMPG1Q17R60 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IMPG1Q17R60 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IMPG1Q17R60 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IMPG1Q17R60 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IMPG1Q17R60 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IMPG1Q17R60 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IMPG1Q17R60 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IMPG1Q17R60 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IMPG1Q17R60 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IMPG1Q17R60 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IMPG1Q17R60 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IMPG1Q17R60 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IMPG1Q17R60 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IMPG1Q17R60 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IMPG1Q17R60 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IMPG1Q17R60 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IMPG1Q17R60 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IMPG1Q17R60 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IMPG1Q17R60 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IMPG1Q17R60 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IMPG1Q17R60 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IMPG1Q17R60 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IMPG1Q17R60 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IMPG1Q17R60 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IMPG1Q17R60 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IMPG1Q17R60 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IMPG1Q17R60 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IMPG1Q17R60 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IMPG1Q17R60 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IMPG1Q17R60 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms