Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRNQ16849 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRNQ16849 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRNQ16849 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRNQ16849 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRNQ16849 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRNQ16849 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRNQ16849 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRNQ16849 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRNQ16849 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRNQ16849 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRNQ16849 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRNQ16849 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRNQ16849 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRNQ16849 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRNQ16849 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRNQ16849 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRNQ16849 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRNQ16849 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRNQ16849 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRNQ16849 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRNQ16849 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRNQ16849 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRNQ16849 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRNQ16849 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRNQ16849 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRNQ16849 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRNQ16849 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRNQ16849 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRNQ16849 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRNQ16849 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRNQ16849 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRNQ16849 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRNQ16849 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRNQ16849 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRNQ16849 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRNQ16849 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRNQ16849 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRNQ16849 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRNQ16849 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRNQ16849 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRNQ16849 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRNQ16849 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRNQ16849 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRNQ16849 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRNQ16849 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRNQ16849 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRNQ16849 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRNQ16849 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRNQ16849 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPRNQ16849 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPRNQ16849 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRNQ16849 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRNQ16849 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRNQ16849 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRNQ16849 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRNQ16849 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRNQ16849 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRNQ16849 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRNQ16849 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRNQ16849 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRNQ16849 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRNQ16849 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRNQ16849 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRNQ16849 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRNQ16849 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRNQ16849 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRNQ16849 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRNQ16849 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRNQ16849 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRNQ16849 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRNQ16849 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRNQ16849 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRNQ16849 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRNQ16849 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRNQ16849 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRNQ16849 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRNQ16849 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRNQ16849 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRNQ16849 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRNQ16849 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRNQ16849 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRNQ16849 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRNQ16849 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRNQ16849 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRNQ16849 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRNQ16849 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PTPRNQ16849 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRNQ16849 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRNQ16849 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PTPRNQ16849 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRNQ16849 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRNQ16849 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRNQ16849 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRNQ16849 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRNQ16849 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRNQ16849 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRNQ16849 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRNQ16849 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRNQ16849 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
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