Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CA9Q16790 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CA9Q16790 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CA9Q16790 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CA9Q16790 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CA9Q16790 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CA9Q16790 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CA9Q16790 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CA9Q16790 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CA9Q16790 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CA9Q16790 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CA9Q16790 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CA9Q16790 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CA9Q16790 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CA9Q16790 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CA9Q16790 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CA9Q16790 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CA9Q16790 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CA9Q16790 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CA9Q16790 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CA9Q16790 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CA9Q16790 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CA9Q16790 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CA9Q16790 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CA9Q16790 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CA9Q16790 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CA9Q16790 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CA9Q16790 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CA9Q16790 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CA9Q16790 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CA9Q16790 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CA9Q16790 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CA9Q16790 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CA9Q16790 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CA9Q16790 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CA9Q16790 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CA9Q16790 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CA9Q16790 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CA9Q16790 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CA9Q16790 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CA9Q16790 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CA9Q16790 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CA9Q16790 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CA9Q16790 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CA9Q16790 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CA9Q16790 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CA9Q16790 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CA9Q16790 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CA9Q16790 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CA9Q16790 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CA9Q16790 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CA9Q16790 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CA9Q16790 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CA9Q16790 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CA9Q16790 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CA9Q16790 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CA9Q16790 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CA9Q16790 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CA9Q16790 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CA9Q16790 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CA9Q16790 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CA9Q16790 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CA9Q16790 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CA9Q16790 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CA9Q16790 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CA9Q16790 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CA9Q16790 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CA9Q16790 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CA9Q16790 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CA9Q16790 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CA9Q16790 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CA9Q16790 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CA9Q16790 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CA9Q16790 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CA9Q16790 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CA9Q16790 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CA9Q16790 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CA9Q16790 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CA9Q16790 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CA9Q16790 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CA9Q16790 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CA9Q16790 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CA9Q16790 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CA9Q16790 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CA9Q16790 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CA9Q16790 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CA9Q16790 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CA9Q16790 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CA9Q16790 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CA9Q16790 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CA9Q16790 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CA9Q16790 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CA9Q16790 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CA9Q16790 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CA9Q16790 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CA9Q16790 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CA9Q16790 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CA9Q16790 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CA9Q16790 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CA9Q16790 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
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