Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
ATP2B3Q16720 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
ATP2B3Q16720 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ATP2B3Q16720 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ATP2B3Q16720 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
ATP2B3Q16720 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ATP2B3Q16720 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ATP2B3Q16720 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ATP2B3Q16720 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ATP2B3Q16720 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ATP2B3Q16720 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ATP2B3Q16720 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ATP2B3Q16720 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ATP2B3Q16720 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ATP2B3Q16720 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ATP2B3Q16720 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ATP2B3Q16720 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ATP2B3Q16720 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ATP2B3Q16720 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ATP2B3Q16720 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ATP2B3Q16720 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ATP2B3Q16720 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ATP2B3Q16720 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ATP2B3Q16720 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
ATP2B3Q16720 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ATP2B3Q16720 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ATP2B3Q16720 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ATP2B3Q16720 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
ATP2B3Q16720 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ATP2B3Q16720 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ATP2B3Q16720 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ATP2B3Q16720 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ATP2B3Q16720 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ATP2B3Q16720 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ATP2B3Q16720 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
ATP2B3Q16720 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ATP2B3Q16720 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ATP2B3Q16720 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ATP2B3Q16720 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
ATP2B3Q16720 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ATP2B3Q16720 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
ATP2B3Q16720 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ATP2B3Q16720 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ATP2B3Q16720 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ATP2B3Q16720 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
ATP2B3Q16720 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ATP2B3Q16720 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ATP2B3Q16720 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ATP2B3Q16720 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATP2B3Q16720 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATP2B3Q16720 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATP2B3Q16720 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATP2B3Q16720 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATP2B3Q16720 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATP2B3Q16720 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ATP2B3Q16720 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ATP2B3Q16720 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ATP2B3Q16720 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ATP2B3Q16720 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ATP2B3Q16720 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ATP2B3Q16720 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ATP2B3Q16720 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ATP2B3Q16720 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATP2B3Q16720 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATP2B3Q16720 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATP2B3Q16720 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATP2B3Q16720 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATP2B3Q16720 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATP2B3Q16720 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ATP2B3Q16720 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ATP2B3Q16720 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATP2B3Q16720 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATP2B3Q16720 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATP2B3Q16720 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ATP2B3Q16720 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ATP2B3Q16720 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ATP2B3Q16720 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
ATP2B3Q16720 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
ATP2B3Q16720 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ATP2B3Q16720 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ATP2B3Q16720 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ATP2B3Q16720 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ATP2B3Q16720 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ATP2B3Q16720 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ATP2B3Q16720 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
ATP2B3Q16720 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ATP2B3Q16720 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ATP2B3Q16720 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ATP2B3Q16720 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ATP2B3Q16720 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ATP2B3Q16720 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ATP2B3Q16720 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ATP2B3Q16720 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ATP2B3Q16720 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATP2B3Q16720 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATP2B3Q16720 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATP2B3Q16720 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATP2B3Q16720 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATP2B3Q16720 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATP2B3Q16720 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
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