Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NTRK3Q16288 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NTRK3Q16288 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NTRK3Q16288 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NTRK3Q16288 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NTRK3Q16288 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NTRK3Q16288 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NTRK3Q16288 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NTRK3Q16288 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NTRK3Q16288 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
NTRK3Q16288 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NTRK3Q16288 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NTRK3Q16288 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NTRK3Q16288 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NTRK3Q16288 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NTRK3Q16288 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NTRK3Q16288 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NTRK3Q16288 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NTRK3Q16288 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NTRK3Q16288 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NTRK3Q16288 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NTRK3Q16288 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NTRK3Q16288 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NTRK3Q16288 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NTRK3Q16288 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NTRK3Q16288 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NTRK3Q16288 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NTRK3Q16288 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NTRK3Q16288 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NTRK3Q16288 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NTRK3Q16288 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NTRK3Q16288 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NTRK3Q16288 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NTRK3Q16288 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NTRK3Q16288 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NTRK3Q16288 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NTRK3Q16288 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NTRK3Q16288 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NTRK3Q16288 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NTRK3Q16288 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NTRK3Q16288 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NTRK3Q16288 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NTRK3Q16288 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NTRK3Q16288 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NTRK3Q16288 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NTRK3Q16288 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NTRK3Q16288 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NTRK3Q16288 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NTRK3Q16288 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NTRK3Q16288 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NTRK3Q16288 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NTRK3Q16288 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NTRK3Q16288 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NTRK3Q16288 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
NTRK3Q16288 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NTRK3Q16288 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NTRK3Q16288 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NTRK3Q16288 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NTRK3Q16288 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NTRK3Q16288 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NTRK3Q16288 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NTRK3Q16288 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NTRK3Q16288 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NTRK3Q16288 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NTRK3Q16288 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NTRK3Q16288 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NTRK3Q16288 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NTRK3Q16288 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NTRK3Q16288 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NTRK3Q16288 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NTRK3Q16288 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NTRK3Q16288 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NTRK3Q16288 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NTRK3Q16288 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NTRK3Q16288 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NTRK3Q16288 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NTRK3Q16288 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
NTRK3Q16288 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NTRK3Q16288 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NTRK3Q16288 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
NTRK3Q16288 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NTRK3Q16288 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NTRK3Q16288 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NTRK3Q16288 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NTRK3Q16288 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NTRK3Q16288 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NTRK3Q16288 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NTRK3Q16288 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NTRK3Q16288 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NTRK3Q16288 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NTRK3Q16288 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NTRK3Q16288 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NTRK3Q16288 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NTRK3Q16288 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NTRK3Q16288 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NTRK3Q16288 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NTRK3Q16288 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NTRK3Q16288 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NTRK3Q16288 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
NTRK3Q16288 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms