Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAMP3Q15836 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAMP3Q15836 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAMP3Q15836 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAMP3Q15836 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAMP3Q15836 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAMP3Q15836 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAMP3Q15836 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAMP3Q15836 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAMP3Q15836 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAMP3Q15836 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAMP3Q15836 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAMP3Q15836 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAMP3Q15836 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAMP3Q15836 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAMP3Q15836 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAMP3Q15836 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAMP3Q15836 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAMP3Q15836 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAMP3Q15836 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAMP3Q15836 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAMP3Q15836 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAMP3Q15836 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAMP3Q15836 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAMP3Q15836 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAMP3Q15836 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAMP3Q15836 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAMP3Q15836 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAMP3Q15836 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAMP3Q15836 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAMP3Q15836 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAMP3Q15836 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAMP3Q15836 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAMP3Q15836 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAMP3Q15836 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VAMP3Q15836 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
VAMP3Q15836 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VAMP3Q15836 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAMP3Q15836 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAMP3Q15836 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAMP3Q15836 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAMP3Q15836 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAMP3Q15836 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAMP3Q15836 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAMP3Q15836 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAMP3Q15836 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAMP3Q15836 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAMP3Q15836 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAMP3Q15836 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAMP3Q15836 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAMP3Q15836 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAMP3Q15836 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAMP3Q15836 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAMP3Q15836 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAMP3Q15836 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAMP3Q15836 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAMP3Q15836 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAMP3Q15836 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAMP3Q15836 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAMP3Q15836 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAMP3Q15836 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAMP3Q15836 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAMP3Q15836 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAMP3Q15836 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAMP3Q15836 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAMP3Q15836 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAMP3Q15836 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAMP3Q15836 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAMP3Q15836 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAMP3Q15836 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAMP3Q15836 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAMP3Q15836 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAMP3Q15836 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAMP3Q15836 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAMP3Q15836 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAMP3Q15836 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAMP3Q15836 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAMP3Q15836 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAMP3Q15836 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAMP3Q15836 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAMP3Q15836 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAMP3Q15836 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAMP3Q15836 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAMP3Q15836 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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