Protein–RNA interactions for Protein: Q15744

CEBPE, CCAAT/enhancer-binding protein epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPEQ15744 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEBPEQ15744 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEBPEQ15744 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEBPEQ15744 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEBPEQ15744 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEBPEQ15744 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEBPEQ15744 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEBPEQ15744 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEBPEQ15744 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEBPEQ15744 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEBPEQ15744 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEBPEQ15744 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEBPEQ15744 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEBPEQ15744 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEBPEQ15744 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEBPEQ15744 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEBPEQ15744 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEBPEQ15744 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEBPEQ15744 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEBPEQ15744 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEBPEQ15744 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEBPEQ15744 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEBPEQ15744 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEBPEQ15744 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEBPEQ15744 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEBPEQ15744 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEBPEQ15744 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEBPEQ15744 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEBPEQ15744 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEBPEQ15744 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CEBPEQ15744 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEBPEQ15744 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEBPEQ15744 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEBPEQ15744 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEBPEQ15744 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEBPEQ15744 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CEBPEQ15744 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEBPEQ15744 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEBPEQ15744 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEBPEQ15744 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEBPEQ15744 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEBPEQ15744 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEBPEQ15744 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEBPEQ15744 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEBPEQ15744 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEBPEQ15744 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEBPEQ15744 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEBPEQ15744 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CEBPEQ15744 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CEBPEQ15744 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CEBPEQ15744 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CEBPEQ15744 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CEBPEQ15744 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEBPEQ15744 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CEBPEQ15744 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEBPEQ15744 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEBPEQ15744 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CEBPEQ15744 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEBPEQ15744 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEBPEQ15744 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEBPEQ15744 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEBPEQ15744 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CEBPEQ15744 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEBPEQ15744 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEBPEQ15744 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEBPEQ15744 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEBPEQ15744 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEBPEQ15744 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEBPEQ15744 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CEBPEQ15744 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEBPEQ15744 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEBPEQ15744 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEBPEQ15744 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CEBPEQ15744 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEBPEQ15744 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEBPEQ15744 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEBPEQ15744 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEBPEQ15744 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEBPEQ15744 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEBPEQ15744 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEBPEQ15744 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEBPEQ15744 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEBPEQ15744 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEBPEQ15744 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEBPEQ15744 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEBPEQ15744 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEBPEQ15744 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEBPEQ15744 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CEBPEQ15744 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEBPEQ15744 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEBPEQ15744 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEBPEQ15744 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEBPEQ15744 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEBPEQ15744 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEBPEQ15744 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CEBPEQ15744 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEBPEQ15744 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEBPEQ15744 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEBPEQ15744 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEBPEQ15744 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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