Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
UBE3CQ15386 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
UBE3CQ15386 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
UBE3CQ15386 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
UBE3CQ15386 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
UBE3CQ15386 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
UBE3CQ15386 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
UBE3CQ15386 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
UBE3CQ15386 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
UBE3CQ15386 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
UBE3CQ15386 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
UBE3CQ15386 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
UBE3CQ15386 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
UBE3CQ15386 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
UBE3CQ15386 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
UBE3CQ15386 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
UBE3CQ15386 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
UBE3CQ15386 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
UBE3CQ15386 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
UBE3CQ15386 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
UBE3CQ15386 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
UBE3CQ15386 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
UBE3CQ15386 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
UBE3CQ15386 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
UBE3CQ15386 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
UBE3CQ15386 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
UBE3CQ15386 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
UBE3CQ15386 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
UBE3CQ15386 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
UBE3CQ15386 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
UBE3CQ15386 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
UBE3CQ15386 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
UBE3CQ15386 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
UBE3CQ15386 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
UBE3CQ15386 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
UBE3CQ15386 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
UBE3CQ15386 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
UBE3CQ15386 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
UBE3CQ15386 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
UBE3CQ15386 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
UBE3CQ15386 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
UBE3CQ15386 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
UBE3CQ15386 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
UBE3CQ15386 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
UBE3CQ15386 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
UBE3CQ15386 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
UBE3CQ15386 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
UBE3CQ15386 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
UBE3CQ15386 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
UBE3CQ15386 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
UBE3CQ15386 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
UBE3CQ15386 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
UBE3CQ15386 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
UBE3CQ15386 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
UBE3CQ15386 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
UBE3CQ15386 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
UBE3CQ15386 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
UBE3CQ15386 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
UBE3CQ15386 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
UBE3CQ15386 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
UBE3CQ15386 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
UBE3CQ15386 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
UBE3CQ15386 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
UBE3CQ15386 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
UBE3CQ15386 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
UBE3CQ15386 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
UBE3CQ15386 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
UBE3CQ15386 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
UBE3CQ15386 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
UBE3CQ15386 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
UBE3CQ15386 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
UBE3CQ15386 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
UBE3CQ15386 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
UBE3CQ15386 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
UBE3CQ15386 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
UBE3CQ15386 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
UBE3CQ15386 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
UBE3CQ15386 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
UBE3CQ15386 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
UBE3CQ15386 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
UBE3CQ15386 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
UBE3CQ15386 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
UBE3CQ15386 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
UBE3CQ15386 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
UBE3CQ15386 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
UBE3CQ15386 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
UBE3CQ15386 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
UBE3CQ15386 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
UBE3CQ15386 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
UBE3CQ15386 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
UBE3CQ15386 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
UBE3CQ15386 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
UBE3CQ15386 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
UBE3CQ15386 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
UBE3CQ15386 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
UBE3CQ15386 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
UBE3CQ15386 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
UBE3CQ15386 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.29
UBE3CQ15386 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
UBE3CQ15386 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
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