Protein–RNA interactions for Protein: Q15345

LRRC41, Leucine-rich repeat-containing protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC41Q15345 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC41Q15345 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC41Q15345 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC41Q15345 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC41Q15345 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC41Q15345 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC41Q15345 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC41Q15345 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC41Q15345 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC41Q15345 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC41Q15345 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LRRC41Q15345 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LRRC41Q15345 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC41Q15345 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC41Q15345 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC41Q15345 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC41Q15345 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC41Q15345 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC41Q15345 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC41Q15345 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC41Q15345 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC41Q15345 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC41Q15345 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC41Q15345 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC41Q15345 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC41Q15345 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC41Q15345 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC41Q15345 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC41Q15345 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC41Q15345 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC41Q15345 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC41Q15345 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC41Q15345 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC41Q15345 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC41Q15345 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC41Q15345 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC41Q15345 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC41Q15345 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC41Q15345 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC41Q15345 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC41Q15345 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC41Q15345 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC41Q15345 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC41Q15345 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC41Q15345 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC41Q15345 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC41Q15345 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC41Q15345 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC41Q15345 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC41Q15345 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC41Q15345 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC41Q15345 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC41Q15345 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC41Q15345 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC41Q15345 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC41Q15345 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC41Q15345 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC41Q15345 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC41Q15345 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC41Q15345 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC41Q15345 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC41Q15345 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC41Q15345 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC41Q15345 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC41Q15345 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC41Q15345 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC41Q15345 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC41Q15345 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC41Q15345 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC41Q15345 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC41Q15345 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC41Q15345 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC41Q15345 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC41Q15345 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC41Q15345 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC41Q15345 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC41Q15345 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC41Q15345 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC41Q15345 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC41Q15345 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC41Q15345 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC41Q15345 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC41Q15345 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
LRRC41Q15345 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC41Q15345 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC41Q15345 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28■■■□□ 2.07
LRRC41Q15345 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC41Q15345 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC41Q15345 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC41Q15345 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28■■■□□ 2.07
LRRC41Q15345 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC41Q15345 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC41Q15345 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC41Q15345 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC41Q15345 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC41Q15345 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC41Q15345 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC41Q15345 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC41Q15345 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC41Q15345 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms