Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARHGEF6Q15052 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARHGEF6Q15052 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARHGEF6Q15052 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARHGEF6Q15052 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARHGEF6Q15052 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARHGEF6Q15052 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARHGEF6Q15052 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARHGEF6Q15052 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARHGEF6Q15052 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARHGEF6Q15052 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARHGEF6Q15052 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARHGEF6Q15052 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARHGEF6Q15052 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ARHGEF6Q15052 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARHGEF6Q15052 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARHGEF6Q15052 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARHGEF6Q15052 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARHGEF6Q15052 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARHGEF6Q15052 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ARHGEF6Q15052 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ARHGEF6Q15052 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARHGEF6Q15052 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARHGEF6Q15052 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARHGEF6Q15052 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARHGEF6Q15052 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARHGEF6Q15052 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF6Q15052 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF6Q15052 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF6Q15052 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF6Q15052 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF6Q15052 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF6Q15052 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARHGEF6Q15052 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARHGEF6Q15052 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARHGEF6Q15052 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ARHGEF6Q15052 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ARHGEF6Q15052 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARHGEF6Q15052 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARHGEF6Q15052 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARHGEF6Q15052 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ARHGEF6Q15052 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARHGEF6Q15052 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARHGEF6Q15052 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARHGEF6Q15052 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARHGEF6Q15052 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF6Q15052 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF6Q15052 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF6Q15052 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF6Q15052 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF6Q15052 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF6Q15052 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF6Q15052 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGEF6Q15052 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGEF6Q15052 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGEF6Q15052 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF6Q15052 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF6Q15052 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF6Q15052 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF6Q15052 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF6Q15052 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ARHGEF6Q15052 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARHGEF6Q15052 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGEF6Q15052 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGEF6Q15052 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGEF6Q15052 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGEF6Q15052 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGEF6Q15052 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGEF6Q15052 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARHGEF6Q15052 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ARHGEF6Q15052 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ARHGEF6Q15052 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARHGEF6Q15052 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARHGEF6Q15052 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGEF6Q15052 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGEF6Q15052 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGEF6Q15052 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGEF6Q15052 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGEF6Q15052 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF6Q15052 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF6Q15052 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF6Q15052 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF6Q15052 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARHGEF6Q15052 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARHGEF6Q15052 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ARHGEF6Q15052 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARHGEF6Q15052 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ARHGEF6Q15052 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARHGEF6Q15052 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARHGEF6Q15052 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARHGEF6Q15052 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARHGEF6Q15052 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARHGEF6Q15052 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARHGEF6Q15052 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARHGEF6Q15052 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARHGEF6Q15052 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARHGEF6Q15052 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARHGEF6Q15052 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARHGEF6Q15052 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGEF6Q15052 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
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