Protein–RNA interactions for Protein: Q14722

KCNAB1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB1Q14722 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNAB1Q14722 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNAB1Q14722 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNAB1Q14722 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNAB1Q14722 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNAB1Q14722 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNAB1Q14722 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNAB1Q14722 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNAB1Q14722 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNAB1Q14722 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNAB1Q14722 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNAB1Q14722 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNAB1Q14722 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNAB1Q14722 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNAB1Q14722 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNAB1Q14722 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNAB1Q14722 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNAB1Q14722 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNAB1Q14722 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNAB1Q14722 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNAB1Q14722 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNAB1Q14722 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNAB1Q14722 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNAB1Q14722 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNAB1Q14722 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNAB1Q14722 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNAB1Q14722 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNAB1Q14722 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNAB1Q14722 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNAB1Q14722 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNAB1Q14722 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNAB1Q14722 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNAB1Q14722 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNAB1Q14722 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNAB1Q14722 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNAB1Q14722 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNAB1Q14722 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNAB1Q14722 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNAB1Q14722 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNAB1Q14722 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNAB1Q14722 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNAB1Q14722 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNAB1Q14722 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNAB1Q14722 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNAB1Q14722 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNAB1Q14722 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNAB1Q14722 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNAB1Q14722 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNAB1Q14722 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNAB1Q14722 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNAB1Q14722 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNAB1Q14722 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNAB1Q14722 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNAB1Q14722 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNAB1Q14722 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNAB1Q14722 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNAB1Q14722 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KCNAB1Q14722 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNAB1Q14722 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNAB1Q14722 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNAB1Q14722 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNAB1Q14722 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNAB1Q14722 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNAB1Q14722 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNAB1Q14722 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNAB1Q14722 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNAB1Q14722 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNAB1Q14722 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNAB1Q14722 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNAB1Q14722 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNAB1Q14722 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNAB1Q14722 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNAB1Q14722 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNAB1Q14722 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNAB1Q14722 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNAB1Q14722 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNAB1Q14722 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNAB1Q14722 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNAB1Q14722 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNAB1Q14722 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNAB1Q14722 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNAB1Q14722 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNAB1Q14722 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNAB1Q14722 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNAB1Q14722 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNAB1Q14722 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNAB1Q14722 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNAB1Q14722 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNAB1Q14722 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNAB1Q14722 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNAB1Q14722 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNAB1Q14722 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNAB1Q14722 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNAB1Q14722 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNAB1Q14722 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNAB1Q14722 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNAB1Q14722 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNAB1Q14722 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNAB1Q14722 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNAB1Q14722 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms