Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA3AQ14563 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3AQ14563 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3AQ14563 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3AQ14563 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3AQ14563 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3AQ14563 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3AQ14563 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3AQ14563 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3AQ14563 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA3AQ14563 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA3AQ14563 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA3AQ14563 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3AQ14563 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3AQ14563 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3AQ14563 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3AQ14563 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3AQ14563 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3AQ14563 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3AQ14563 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3AQ14563 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3AQ14563 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3AQ14563 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3AQ14563 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3AQ14563 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3AQ14563 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3AQ14563 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3AQ14563 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3AQ14563 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3AQ14563 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3AQ14563 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3AQ14563 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA3AQ14563 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA3AQ14563 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA3AQ14563 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA3AQ14563 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA3AQ14563 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA3AQ14563 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA3AQ14563 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3AQ14563 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3AQ14563 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3AQ14563 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3AQ14563 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA3AQ14563 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA3AQ14563 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA3AQ14563 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA3AQ14563 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3AQ14563 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3AQ14563 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3AQ14563 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3AQ14563 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3AQ14563 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3AQ14563 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3AQ14563 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEMA3AQ14563 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEMA3AQ14563 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEMA3AQ14563 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEMA3AQ14563 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEMA3AQ14563 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEMA3AQ14563 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA3AQ14563 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA3AQ14563 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA3AQ14563 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA3AQ14563 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA3AQ14563 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA3AQ14563 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3AQ14563 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3AQ14563 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3AQ14563 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3AQ14563 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3AQ14563 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3AQ14563 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3AQ14563 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3AQ14563 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3AQ14563 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3AQ14563 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3AQ14563 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3AQ14563 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3AQ14563 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3AQ14563 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3AQ14563 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3AQ14563 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3AQ14563 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3AQ14563 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3AQ14563 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3AQ14563 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3AQ14563 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA3AQ14563 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA3AQ14563 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA3AQ14563 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA3AQ14563 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA3AQ14563 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA3AQ14563 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA3AQ14563 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA3AQ14563 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA3AQ14563 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA3AQ14563 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA3AQ14563 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA3AQ14563 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA3AQ14563 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
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