Protein–RNA interactions for Protein: Q14112

NID2, Nidogen-2, humanhuman

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Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID2Q14112 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NID2Q14112 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NID2Q14112 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NID2Q14112 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NID2Q14112 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NID2Q14112 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NID2Q14112 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NID2Q14112 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NID2Q14112 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NID2Q14112 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
NID2Q14112 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NID2Q14112 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NID2Q14112 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NID2Q14112 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NID2Q14112 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NID2Q14112 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NID2Q14112 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NID2Q14112 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NID2Q14112 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NID2Q14112 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NID2Q14112 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NID2Q14112 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NID2Q14112 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NID2Q14112 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NID2Q14112 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NID2Q14112 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NID2Q14112 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NID2Q14112 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NID2Q14112 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NID2Q14112 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NID2Q14112 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NID2Q14112 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NID2Q14112 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NID2Q14112 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NID2Q14112 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NID2Q14112 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NID2Q14112 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NID2Q14112 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NID2Q14112 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NID2Q14112 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NID2Q14112 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NID2Q14112 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NID2Q14112 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NID2Q14112 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NID2Q14112 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NID2Q14112 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NID2Q14112 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NID2Q14112 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NID2Q14112 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NID2Q14112 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NID2Q14112 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NID2Q14112 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NID2Q14112 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NID2Q14112 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NID2Q14112 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NID2Q14112 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NID2Q14112 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NID2Q14112 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NID2Q14112 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NID2Q14112 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NID2Q14112 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
NID2Q14112 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
NID2Q14112 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NID2Q14112 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NID2Q14112 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NID2Q14112 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NID2Q14112 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
NID2Q14112 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NID2Q14112 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NID2Q14112 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NID2Q14112 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NID2Q14112 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NID2Q14112 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NID2Q14112 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NID2Q14112 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NID2Q14112 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NID2Q14112 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NID2Q14112 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NID2Q14112 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NID2Q14112 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NID2Q14112 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NID2Q14112 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NID2Q14112 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NID2Q14112 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NID2Q14112 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NID2Q14112 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NID2Q14112 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NID2Q14112 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NID2Q14112 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NID2Q14112 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NID2Q14112 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NID2Q14112 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NID2Q14112 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NID2Q14112 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NID2Q14112 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NID2Q14112 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
NID2Q14112 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NID2Q14112 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NID2Q14112 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NID2Q14112 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
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