Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX39BQ13838 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX39BQ13838 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX39BQ13838 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX39BQ13838 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX39BQ13838 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX39BQ13838 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX39BQ13838 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX39BQ13838 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX39BQ13838 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX39BQ13838 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX39BQ13838 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX39BQ13838 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX39BQ13838 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX39BQ13838 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX39BQ13838 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX39BQ13838 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX39BQ13838 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX39BQ13838 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX39BQ13838 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX39BQ13838 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX39BQ13838 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX39BQ13838 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX39BQ13838 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX39BQ13838 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX39BQ13838 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX39BQ13838 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX39BQ13838 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX39BQ13838 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX39BQ13838 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX39BQ13838 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX39BQ13838 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX39BQ13838 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX39BQ13838 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX39BQ13838 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX39BQ13838 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX39BQ13838 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX39BQ13838 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX39BQ13838 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX39BQ13838 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX39BQ13838 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX39BQ13838 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX39BQ13838 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX39BQ13838 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX39BQ13838 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX39BQ13838 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX39BQ13838 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX39BQ13838 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX39BQ13838 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX39BQ13838 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX39BQ13838 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX39BQ13838 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX39BQ13838 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX39BQ13838 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX39BQ13838 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX39BQ13838 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX39BQ13838 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX39BQ13838 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX39BQ13838 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX39BQ13838 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX39BQ13838 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX39BQ13838 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX39BQ13838 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX39BQ13838 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX39BQ13838 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX39BQ13838 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX39BQ13838 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX39BQ13838 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX39BQ13838 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX39BQ13838 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX39BQ13838 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX39BQ13838 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX39BQ13838 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX39BQ13838 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX39BQ13838 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX39BQ13838 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX39BQ13838 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX39BQ13838 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX39BQ13838 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX39BQ13838 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX39BQ13838 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX39BQ13838 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX39BQ13838 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX39BQ13838 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX39BQ13838 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX39BQ13838 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX39BQ13838 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX39BQ13838 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX39BQ13838 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX39BQ13838 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX39BQ13838 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DDX39BQ13838 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDX39BQ13838 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDX39BQ13838 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX39BQ13838 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX39BQ13838 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX39BQ13838 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX39BQ13838 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX39BQ13838 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX39BQ13838 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
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