Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOFQ13790 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOFQ13790 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOFQ13790 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOFQ13790 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOFQ13790 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
APOFQ13790 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOFQ13790 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOFQ13790 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOFQ13790 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOFQ13790 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOFQ13790 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOFQ13790 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOFQ13790 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOFQ13790 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOFQ13790 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOFQ13790 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOFQ13790 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOFQ13790 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOFQ13790 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOFQ13790 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOFQ13790 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOFQ13790 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOFQ13790 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOFQ13790 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOFQ13790 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOFQ13790 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOFQ13790 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOFQ13790 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOFQ13790 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
APOFQ13790 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOFQ13790 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOFQ13790 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOFQ13790 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOFQ13790 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOFQ13790 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOFQ13790 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
APOFQ13790 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
APOFQ13790 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOFQ13790 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOFQ13790 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOFQ13790 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOFQ13790 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOFQ13790 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOFQ13790 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOFQ13790 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOFQ13790 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOFQ13790 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOFQ13790 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOFQ13790 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOFQ13790 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOFQ13790 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOFQ13790 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOFQ13790 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOFQ13790 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOFQ13790 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOFQ13790 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOFQ13790 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOFQ13790 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOFQ13790 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOFQ13790 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOFQ13790 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOFQ13790 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOFQ13790 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
APOFQ13790 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOFQ13790 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOFQ13790 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
APOFQ13790 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOFQ13790 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOFQ13790 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOFQ13790 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOFQ13790 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOFQ13790 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOFQ13790 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOFQ13790 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOFQ13790 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOFQ13790 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOFQ13790 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOFQ13790 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOFQ13790 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOFQ13790 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOFQ13790 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOFQ13790 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOFQ13790 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
APOFQ13790 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOFQ13790 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOFQ13790 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOFQ13790 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOFQ13790 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
APOFQ13790 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOFQ13790 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOFQ13790 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOFQ13790 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOFQ13790 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOFQ13790 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOFQ13790 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOFQ13790 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOFQ13790 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOFQ13790 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOFQ13790 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
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